基因页：Twist1

概括？
基因 7291
象征 Twist1
同义词 acs3 | bpes2 | bpes3 | crs | crs1 | cso | scs | twist | bhlha38
描述 扭曲家庭BHLH转录因子1
参考 MIM：601622|HGNC：HGNC：12428|ENSEMBL：ENSG00000122691|HPRD：03374|Vega：Otthumg0000000090821
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p21.2
Pascal P值 0.345
胎儿β -0.705
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG24446548 7 19157263 Twist1 0.013 2.524 DMG：Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ube2d3 0.93 0.91
mobkl3 0.93 0.93
TMed2 0.92 0.90
带子 0.91 0.88
Rab2a 0.91 0.89
PPP1CB 0.91 0.87
COPS3 0.90 0.85
ptges3 0.90 0.86
OLA1 0.90 0.87
跑 0.90 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.71 -0.68
AF347015.26 -0.71 -0.69
AF347015.33 -0.70 -0.68
AF347015.8 -0.69 -0.68
AF347015.2 -0.69 -0.66
mt-cyb -0.69 -0.67
AF347015.15 -0.66 -0.66
FXYD1 -0.65 -0.68
GPT -0.65 -0.69
AF347015.31 -0.64 -0.63

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003677 DNA结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 18598946
去：0004857 酶抑制剂活性 塔斯 10025406
GO：0030528 转录调节器活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001764 神经元迁移 IEA 神经元（GO期限：8） -
GO：0000122 RNA聚合酶II启动子的转录负调控 塔斯 10025406
去：0001501 骨骼系统开发 塔斯 8988166
去：0001843 神经管闭合 IEA -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0009653 解剖结构形态发生 塔斯 8988166
去：0006915 凋亡 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
GO：0035115 胚胎前肢形态发生 IEA -
GO：0035137 后肢形态发生 IEA -
GO：0045843 横纹肌发育的负调节 IEA -
GO：0045596 细胞分化的负调控 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Biocarta ARF途径 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF2Pathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid his hey pathway 48 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu肿瘤脉管系统 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Cisplatin抗性 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王HCP前列腺癌 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林青春期乳腺 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染8小时DN 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D8 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌中甲基化的甲基化 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的甲基化 56 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
nadella prkar1a靶向 9 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
怀特福德小儿癌标记 116 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu肿瘤内皮标记 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 67 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤DN 26 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-151 76 83 1A，M8 HSA-MIR-151脑 Acuagacugaagcucuugagg
mir-25/32/92/363/367 676 682 1a HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-326 55 61 1a HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-33 602 608 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-361 265 271 M8 HSA-MIR-361脑 uuaucagaaucuccagggguac
mir-381 663 669 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-409-3p 568 574 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-543 320 326 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu