基因页:C7
概括?
基因 | 730 |
象征 | C7 |
同义词 | - |
描述 | 补体组件7 |
参考 | MIM:217070|HGNC:HGNC:1346|Ensembl:ENSG00000112936|HPRD:01957|Vega:Otthumg00000150340 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5p13 |
Pascal P值 | 0.391 |
胎儿β | -0.471 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16825495 | CHR2 | 134234401 | C7 | 730 | 0.05 | 反式 | ||
RS1691463 | CHR3 | 84914366 | C7 | 730 | 0.11 | 反式 | ||
RS394185 | CHR3 | 84959076 | C7 | 730 | 0.16 | 反式 | ||
RS6449550 | CHR5 | 61034312 | C7 | 730 | 0.05 | 反式 | ||
RS1937367 | CHR6 | 94572784 | C7 | 730 | 0.1 | 反式 | ||
RS4514358 | Chr10 | 43861923 | C7 | 730 | 0.02 | 反式 | ||
RS305050 | CHR15 | 70089797 | C7 | 730 | 0.01 | 反式 | ||
RS11873703 | CHR18 | 61448702 | C7 | 730 | 0.08 | 反式 | ||
RS6095741 | CHR20 | 48666589 | C7 | 730 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
UHRF1BP1L | 0.84 | 0.84 |
SNX13 | 0.83 | 0.82 |
FAM69A | 0.83 | 0.83 |
Ptplad1 | 0.83 | 0.82 |
SPTLC1 | 0.82 | 0.82 |
GMFB | 0.82 | 0.83 |
GFM1 | 0.82 | 0.82 |
NCKAP1 | 0.82 | 0.82 |
DNAJC3 | 0.82 | 0.82 |
猪 | 0.82 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL022328.1 | -0.53 | -0.56 |
IL32 | -0.45 | -0.34 |
C16orf79 | -0.45 | -0.50 |
nudt8 | -0.44 | -0.48 |
AF347015.21 | -0.44 | -0.23 |
IRF7 | -0.44 | -0.53 |
AC135724.1 | -0.42 | -0.43 |
apoc1 | -0.41 | -0.25 |
AF347015.18 | -0.40 | -0.24 |
C1orf61 | -0.40 | -0.43 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg补充和凝结级联 | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Prion疾病 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Lair Pathway | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta经典途径 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Comp Pathway | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔凝集素途径 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome补充级联 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN | 175 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤DN | 104 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tang衰老TP53靶向 | 33 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
瓦特自动甲状腺腺瘤DN | 55 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tomlins前列腺癌DN | 40 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约瑟夫对丁酸钠DN的反应 | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CCND1和CDK4的Molenaar靶标 | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng IL22信号传导DN | 42 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 DN | 170 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen滑膜肉瘤DN | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |