SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因	7321
象征	UBE2D1
Synonyms	E2(17)KB1\|SFT\|UBC4/5\|UBCH5\|UBCH5A
Description	ubiquitin conjugating enzyme E2 D1
参考	MIM:602961\|HGNC:HGNC:12474\|Ensembl:ENSG00000072401\|HPRD:04267\|Vega：Otthumg0000000018269
Gene type	protein-coding
Map location	10q21.1
Pascal p-value	0.125
Fetal beta	1.247
eGene	Anterior cingulate cortex BA24

数据源中的基因

Gene set name	Method of gene set	Description	Info
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
PMID:cooccur	High-throughput literature-search	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	High-throughput literature-search	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

eQTL annotation

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	Gene Entrez ID	pvalue	qvalue	TSS distance	EQTL类型
rs2537663	10	59717561	UBE2D1	ENSG0000000072401.10	3.99756E-6	0.04	-377174	gtex_brain_ba24
rs2658634	10	59717602	UBE2D1	ENSG0000000072401.10	3.75095E-6	0.04	-377133	gtex_brain_ba24
rs10763525	10	59720154	UBE2D1	ENSG0000000072401.10	3.13621E-6	0.04	-374581	gtex_brain_ba24

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
BARD1	-	BRCA1 associated RING domain 1	Reconstituted Complex	BioGRID	11278247\|11927591 \|12438698\|12485996 \|12887909\|12890688 \|14636569\|15184379
BIRC3	AIP1 \|API2 \|CIAP2 \|haip1 \|hiap1 \|MALT2 \|mihc \|RNF49	baculoviral IAP repeat-containing 3	The cIAP-2 promoter interacts with Ubc5.	BIND	15494311
BRCA1	BRCAI \| BRCC1 \| IRIS \| PSCP \| RNF53	breast cancer 1, early onset	Reconstituted Complex	BioGRID	11278247\|11927591 \|12438698\|12485996 \|12732733\|12887909 \|12890688\|14636569 \|14638690\|15184379
BRCC3	BRCC36 \| C6.1A \| CXorf53	BRCA1/BRCA2-containing complex, subunit 3	Reconstituted Complex	BioGRID	14636569
布雷	BRCC4 \|BRCC45	brain and reproductive organ-expressed (TNFRSF1A modulator)	Reconstituted Complex	BioGRID	14636569
DTX3L	BBAP	Deltex 3类（果蝇）	-	HPRD,BioGRID	12670957
FANCD2	DKFZp762A223 \| FA-D2 \| FA4 \| FACD \| FAD \| FAD2 \| FANCD \| FLJ23826	Fanconi贫血，互补组D2	Reconstituted Complex	BioGRID	12887909
MDM4	DKFZP781B1423 \|HDMX \|MDMX \|MGC132766 \|MRP1	Mdm4 p53 binding protein homolog (mouse)	Reconstituted Complex	BioGRID	12393902
RNF11	CGI-123 \| MGC51169 \| SID1669	ring finger protein 11	RNF11与UBCH5A相互作用。	BIND	14562029
RNF126	FLJ20552 \| MGC1022 \| MGC14317	ring finger protein 126	两个杂交	BioGRID	16189514
RNF2	BAP-1 \| BAP1 \| DING \| HIPI3 \| RING1B \| RING2	ring finger protein 2	Biochemical Activity	BioGRID	11513855
SIAH1	FLJ08065 \| HUMSIAH \| Siah-1 \| Siah-1a \| hSIAH1	缺席同源物1（果蝇）中有七个	-	HPRD,BioGRID	11389839
Stub1	CHIP \| HSPABP2 \| NY-CO-7 \| SDCCAG7 \| UBOX1	STIP1 homology and U-box containing protein 1	-	HPRD	11557750
trim39	MGC32984 \| RNF23 \| TFP \| TRIM39B	tripartite motif-containing 39	两个杂交	BioGRID	16189514
UBE3A	ancr \|AS \|e6-ap \|epve6ap \|FLJ26981 \|HPVE6A	ubiquitin protein ligase E3A	-	HPRD,BioGRID	10066826
Ubox5	KIAA0860 \| RNF37 \| UBCE7IP5 \| UIP5	u-box域包含5	-	HPRD	11274149

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	# SZGR 2.0 genes in pathway	Info
KEGG UBIQUITIN MEDIATED PROTEOLYSIS	138	98	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1 INTERNALIZATION PATHWAY	41	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53 REGULATION PATHWAY	59	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INHIBITION OF THE PROTEOLYTIC ACTIVITY OF APC C REQUIRED FOR THE ONSET OF ANAPHASE BY MITOTIC SPINDLE CHECKPOINT COMPONENTS	24	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE	421	253	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY BMP	23	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF HYPOXIA INDUCIBLE FACTOR HIF BY OXYGEN	25	17	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME OXYGEN DEPENDENT PROLINE HYDROXYLATION OF HYPOXIA INDUCIBLE FACTOR ALPHA	18	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD2 SMAD3 SMAD4异三聚体的反应组转录活性	38	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNREGULATION OF SMAD2 3 SMAD4 TRANSCRIPTIONAL ACTIVITY	20	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通用转录途径	352	181	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE MITOTIC	325	185	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期检查点	124	70	该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节	85	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RIG I MDA5信号的负调节器	31	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钻机I MDA5介导的IFNαβ途径的诱导	73	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDH1 MEDIATED DEGRADATION OF CDC20 AND OTHER APC C CDH1 TARGETED PROTEINS IN LATE MITOSIS EARLY G1	72	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDC20 MEDIATED DEGRADATION OF MITOTIC PROTEINS	73	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解	64	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM	279	178	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDC20 MEDIATED DEGRADATION OF CYCLIN B	26	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFβ受体复合物的反应组信号传导	63	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CONVERSION FROM APC C CDC20 TO APC C CDH1 IN LATE ANAPHASE	22	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM	933	616	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PHOSPHORYLATION OF THE APC C	23	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME适应性免疫系统	539	350	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION	251	156	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING UBIQUITINATION PROTEASOME DEGRADATION	212	129	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC CDC20介导的NEK2A降解	28	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS DUCTAL NORMAL UP	44	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL UP	73	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC LEUKEMIA UP	368	234	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤	305	185	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL DN	275	168	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 2HR DN	88	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 6HR DN	167	100	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR UP	557	331	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP	169	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP	811	508	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤	165	104	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215	893	528	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML SURVIVAL	129	87	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION UP	314	201	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn	153	120	该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN	228	146	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB HEART ATRIUM VS VENTRICLE DN	261	183	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED	1022	619	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO METHYLATED IN LIVER CANCER DN	940	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI PLASMACYTOMA UP	259	185	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHNG MULTIPLE MYELOMA HYPERPLOID DN	28	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN	175	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEDDEN LUNG CANCER POOR SURVIVAL A6	456	285	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 5	33	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SAKAI CHRONIC HEPATITIS VS LIVER CANCER UP	83	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN	321	200	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标	824	528	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN	784	464	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RATTENBACHER BOUND BY CELF1	467	251	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Gene Page:UBE2D1