基因页:ube2d3
概括?
基因 | 7323 |
象征 | ube2d3 |
同义词 | e2(17)kb3 | ubc4/5 | ubch5c |
描述 | 泛素结合酶E2 D3 |
参考 | MIM:602963|HGNC:HGNC:12476|ENSEMBL:ENSG00000109332|HPRD:04269|Vega:Otthumg00000131119 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q24 |
Pascal P值 | 6.363E-5 |
Sherlock P值 | 0.402 |
胎儿β | 0.592 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21866054 | 4 | 103748674 | ube2d3 | 2.7E-10 | -0.021 | 6.45e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UBE2D3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID NFKAPPAB规范途径 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1内部化途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID BARD1途径 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BMP的Reactome信号传导 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组对缺氧HIF的低氧诱导因子HIF调节 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组氧依赖性脯氨酸羟基诱导因子α的羟基化 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMAD2 SMAD3 SMAD4异三聚体的反应组转录活性 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2 3 Smad4转录活性的反应组下调 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RIG I MDA5信号的负调节器 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钻机I MDA5介导的IFNαβ途径的诱导 | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFβ受体复合物的反应组信号传导 | 63 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞数量小vs巨大 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Radaeva对IFNA1的响应 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pomeroy髓母细胞瘤预后DN | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张抗病毒对利巴韦林DN的反应 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai慢性肝炎与肝癌 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |