基因页：ube3a
概括？
| 基因 | 7337 |
| 象征 | ube3a |
| 同义词 | ancr | as | e6-ap | epve6ap | hpve6a |
| 描述 | 泛素蛋白连接酶E3A |
| 参考 | MIM：601623|HGNC：HGNC：12496|ENSEMBL：ENSG00000114062|HPRD：03375|Vega：Otthumg00000171548 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q11.2 |
| Pascal P值 | 0.681 |
| Sherlock P值 | 0.63 |
| 胎儿β | 0.778 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18766912 | 15 | 25683909 | ube3a | -0.051 | 0.29 | DMG：Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| arl2 | 0.45 | 0.30 |
| clec9a | 0.41 | 0.14 |
| CNFN | 0.41 | 0.22 |
| HLA-DPB1 | 0.41 | 0.29 |
| HLA-DRA | 0.39 | 0.23 |
| HLA-DMA | 0.38 | 0.22 |
| trac | 0.38 | 0.22 |
| HLA-DPA1 | 0.38 | 0.23 |
| cdc42ep1 | 0.38 | 0.26 |
| CD74 | 0.38 | 0.19 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GNB4 | -0.17 | -0.09 |
| DPP4 | -0.16 | -0.09 |
| C14orf37 | -0.16 | -0.08 |
| NAV3 | -0.16 | -0.06 |
| PCDH11Y | -0.16 | -0.15 |
| pde4d | -0.16 | -0.06 |
| mpped1 | -0.16 | -0.07 |
| SSBP2 | -0.16 | -0.04 |
| Rab39 | -0.15 | -0.05 |
| klhl1 | -0.15 | -0.06 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16493710 | |
| 去：0004842 | 泛素 - 蛋白连接酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016881 | 酸 - 氨基酸连接酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007420 | 大脑发育 | 塔斯 | 大脑（GO期限：7） | 8988171 |
| 去：0006464 | 蛋白质修饰过程 | IEA | - | |
| 去：0006508 | 蛋白水解 | 塔斯 | 8221889 | |
| 去：0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | 塔斯 | 8221889 | |
| GO：0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| GO：0043234 | 蛋白质复合物 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Bard1 | - | BRCA1相关环域1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12890688 |
| BLK | MGC10442 | B淋巴酪氨酸激酶 | - | HPRD，Biogrid | 10449731 |
| BPY2 | bpy2a |VCY2 |VCY2A | 基本电荷，Y连锁，2 | - | HPRD，Biogrid | 12207887 |
| BPY2B | bpy2 |VCY2 |VCY2B | 基本电荷，Y连锁，2B | - | HPRD | 12207887 |
| BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1，早发 | 重构的复合物 | Biogrid | 12890688 |
| Cul7 | KIAA0076 |DJ20C7.5 | 卡林7 | - | HPRD | 12481031 |
| LCK | yt16 |p56lck |pp58lck | 淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 10449731 |
| MCM7 | CDABP0042 |cdc47 |MCM2 |P1.1-MCM3 |P1CDC47 |p85mcm |PNAS-146 | 微型鲜体维护复杂组件7 | - | HPRD，Biogrid | 9852095 |
| PGR | NR3C3 |PR | 孕酮受体 | - | HPRD，Biogrid | 9891052 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD | 9143503|9369221 |
| TSC2 | FLJ43106 |林|TSC4 | 结节硬化2 | 重构的复合物 | Biogrid | 15175323 |
| ube2d1 | E2（17）KB1 |sft |UBC4/5 |ubch5 |ubch5a | 泛素结合酶E2d 1（UBC4/5同源物，酵母） | - | HPRD，Biogrid | 10066826 |
| ube2d2 | E2（17）KB2 |pubc1 |ubc4 |UBC4/5 |UBCH5B | 泛素结合酶E2d 2（UBC4/5同源物，酵母） | 生化活动 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9182527|9990509 |
| ube2d3 | E2（17）KB3 |MGC43926 |MGC5416 |UBC4/5 |UBCH5C | 泛素结合酶E2d 3（UBC4/5同源物，酵母） | - | HPRD，Biogrid | 9990509 |
| ube2e1 | ubch6 | 泛素结合酶E2E 1（UBC4/5同源物，酵母） | - | HPRD | 8576257 |
| ube2g1 | E217K |UBC7 |ube2g | 泛素结合酶E2G 1（UBC7同源物，酵母） | - | HPRD | 10558980 |
| ube2g2 | UBC7 | 泛素结合酶E2G 2（UBC7同源物，酵母） | - | HPRD | 10558980 |
| ube2l3 | E2-F1 |l-ubc |ubch7 |UBCM4 | 泛素结合酶E2L 3 | UBCH7与E6AP相互作用。 | 绑定 | 9153201 |
| ube2l3 | E2-F1 |l-ubc |ubch7 |UBCM4 | 泛素结合酶E2L 3 | 生化活动 共晶结构 |
Biogrid | 8576257|9990509 |10558980 |
| ube2l3 | E2-F1 |l-ubc |ubch7 |UBCM4 | 泛素结合酶E2L 3 | - | HPRD | 8576257|10558980 |
| UBE2L6 | MGC40331 |rig-b |UBCH8 | 泛素结合酶E2L 6 | UBCH8与E6AP相互作用。 | 绑定 | 9153201 |
| UBE2L6 | MGC40331 |rig-b |UBCH8 | 泛素结合酶E2L 6 | - | HPRD | 10558980 |
| UBQLN2 | Chap1 |Chap1/dsk2 |DSK2 |HRIHFB2157 |LIC-2 |N4BP4 |PLIC-2 |plic2 |RIHFB2157 | 泛素2 | - | HPRD，Biogrid | 10983987 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta蛋白酶体途径 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID AR途径 | 61 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID端粒酶途径 | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 悍马皮肤癌进度DN | 100 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 公园HSC vs多功能祖先DN | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Magrangeas多发性骨髓瘤Igll vs Iglk | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 郭十六进制目标 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU对维甲酸DN的响应 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄蛋白酶体基因模块 | 49 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk早期腹部卵泡 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sakai慢性肝炎与肝癌 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时 | 55 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gregory合成致死与伊马替尼 | 145 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Brideau印迹基因 | 63 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |