基因页：OSGIN2
概括？
| 基因 | 734 |
| 象征 | OSGIN2 |
| 同义词 | C8orf1 | HT41 |
| 描述 | 氧化应激诱导生长抑制剂家族成员2 |
| 参考 | MIM：604598|HGNC：HGNC：1355|ENSEMBL：ENSG00000164823|HPRD：06853|Vega：Otthumg00000163811 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q21 |
| Pascal P值 | 0.073 |
| Sherlock P值 | 0.262 |
| DEG P值 | DEG：SANDERS_2014：DS1_P = 0.146：DS1_BETA = 0.038600：DS2_P = 3.15E-01：DS2_BETA = -0.050：DS2_FDR = 5.69e-011 |
| 胎儿β | -1.136 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 海马 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06774441 | 8 | 90915076 | OSGIN2 | 1.42E-8 | -0.009 | 5.5e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS389848 | 8 | 90796967 | OSGIN2 | ENSG00000164823.5 | 4.54024E-6 | 0.01 | -117120 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS372981 | 8 | 90796968 | OSGIN2 | ENSG00000164823.5 | 6.09391E-6 | 0.01 | -117119 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS441547 | 8 | 90820182 | OSGIN2 | ENSG00000164823.5 | 1.82087E-6 | 0.01 | -93905 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS441548 | 8 | 90820183 | OSGIN2 | ENSG00000164823.5 | 1.82125E-6 | 0.01 | -93904 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DHP | 0.94 | 0.93 |
| ARMC6 | 0.94 | 0.92 |
| FAM89B | 0.94 | 0.92 |
| DDX49 | 0.94 | 0.92 |
| PTOV1 | 0.93 | 0.94 |
| EEFSEC | 0.93 | 0.91 |
| thap11 | 0.92 | 0.91 |
| EEF2 | 0.92 | 0.94 |
| STX5 | 0.92 | 0.91 |
| Med22 | 0.92 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.33 | -0.72 | -0.85 |
| AF347015.27 | -0.72 | -0.84 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.83 |
| AF347015.8 | -0.71 | -0.84 |
| mt-cyb | -0.70 | -0.83 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.81 |
| AF347015.15 | -0.69 | -0.83 |
| AF347015.26 | -0.67 | -0.83 |
| AF347015.2 | -0.67 | -0.83 |
| S100B | -0.65 | -0.78 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gargalovic对氧化磷脂的反应黑色 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 克拉斯的iwanaga致癌作用 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mirlet7a3的Brueckner目标 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN NPAS4靶向DN | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ghandhi旁观者辐照 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |