基因页面:UCN
总结吗?
GeneID | 7349年 |
象征 | UCN |
同义词 | UI | UROC |
描述 | urocortin |
参考 | MIM: 600945|HGNC: HGNC: 12516|HPRD: 02970| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2 p23.3 |
帕斯卡假定值 | 0.003 |
夏洛克假定值 | 0.776 |
胎儿β | -0.234 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg06536868 | 2 | 27530884 | UCN | 5.16 e-5 | 0.497 | 0.022 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs17013397 | chr2 | 126947776 | UCN | 7349年 | 0.14 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UCN_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MBD3 | 0.81 | 0.78 |
INO80B | 0.78 | 0.74 |
CPSF3L | 0.78 | 0.72 |
MAD1L1 | 0.77 | 0.73 |
SIRT7 | 0.77 | 0.73 |
PPAN | 0.77 | 0.72 |
MXD4 | 0.77 | 0.75 |
RING1 | 0.77 | 0.72 |
ZNF787 | 0.77 | 0.73 |
STK11 | 0.77 | 0.74 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.54 | -0.51 |
AF347015.21 | -0.50 | -0.49 |
MT-CYB | -0.50 | -0.48 |
MT-CO2 | -0.49 | -0.46 |
AF347015.27 | -0.48 | -0.49 |
AF347015.8 | -0.46 | -0.45 |
AF347015.2 | -0.45 | -0.43 |
AF347015.15 | -0.44 | -0.46 |
AF347015.33 | -0.44 | -0.43 |
AF347015.9 | -0.44 | -0.46 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005184 | 神经肽激素活动 | 助教 | 轴突,Synap、脑、神经递质(术语层面:6) | 8612563 |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007186 | g蛋白耦合受体蛋白信号通路 | 助教 | 8612563 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马脑垂体胎儿和成人 | 29日 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHYLA CBFA2T3目标了 | 387年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |