概括
基因 7368
象征 UGT8
同义词 CGT | UGT4
描述 UDP糖基转移酶8
参考 MIM:601291|HGNC:HGNC:12555|ENSEMBL:ENSG00000174607|HPRD:03186|Vega:Otthumg00000132915
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q26
Pascal P值 0.608
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00856157 4 115519920 UGT8 3.45e-8 -0.012 1.02E-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7627622 CHR3 33850148 UGT8 7368 0.1 反式
RS6829546 CHR4 12587664 UGT8 7368 0.06 反式
RS6448932 CHR4 12595798 UGT8 7368 0.01 反式
RS7830259 CHR8 14087643 UGT8 7368 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
COPS2 0.89 0.90
ACTR6 0.89 0.89
DCTN6 0.89 0.87
ptges3 0.88 0.86
NCK1 0.87 0.85
TCEAL8 0.87 0.86
ube2n 0.87 0.83
sub1 0.86 0.83
ZFAND6 0.86 0.83
PSMD10 0.86 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.8 -0.59 -0.58
MT-CO2 -0.59 -0.56
AF347015.2 -0.58 -0.58
AF347015.26 -0.58 -0.59
mt-cyb -0.58 -0.58
AF347015.33 -0.57 -0.57
AF347015.15 -0.57 -0.58
AF347015.18 -0.54 -0.57
AF347015.27 -0.54 -0.55
GPT -0.53 -0.57

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003851 2-羟基酰基肾上腺素1-β-半乳糖基转移酶活性 IEA -
GO:0016758 转移酶活性,转移己糖基团 IEA -
去:0008489 UDP-半乳糖:葡萄糖基酰胺β-1,4-半乳糖基转移酶活性活性 塔斯 8661025
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007417 中枢神经系统发展 塔斯 大脑(GO期限:6) 8661025
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0007422 周围神经系统发展 塔斯 8661025
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg鞘脂代谢 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 DN 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG乳腺癌ESR1激光DN 50 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌B 48 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王前列腺癌雄激素独立 66 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landemaine肺转移 21 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt的反应48小时 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krasnoselskaya ILF3靶向DN 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert核心少突胶质细胞分化 40 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移DN 53 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 238 244 1a HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-218 161 168 1A,M8 HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu