基因页:UGT8
概括?
基因 | 7368 |
象征 | UGT8 |
同义词 | CGT | UGT4 |
描述 | UDP糖基转移酶8 |
参考 | MIM:601291|HGNC:HGNC:12555|ENSEMBL:ENSG00000174607|HPRD:03186|Vega:Otthumg00000132915 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q26 |
Pascal P值 | 0.608 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00856157 | 4 | 115519920 | UGT8 | 3.45e-8 | -0.012 | 1.02E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7627622 | CHR3 | 33850148 | UGT8 | 7368 | 0.1 | 反式 | ||
RS6829546 | CHR4 | 12587664 | UGT8 | 7368 | 0.06 | 反式 | ||
RS6448932 | CHR4 | 12595798 | UGT8 | 7368 | 0.01 | 反式 | ||
RS7830259 | CHR8 | 14087643 | UGT8 | 7368 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UGT8_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
COPS2 | 0.89 | 0.90 |
ACTR6 | 0.89 | 0.89 |
DCTN6 | 0.89 | 0.87 |
ptges3 | 0.88 | 0.86 |
NCK1 | 0.87 | 0.85 |
TCEAL8 | 0.87 | 0.86 |
ube2n | 0.87 | 0.83 |
sub1 | 0.86 | 0.83 |
ZFAND6 | 0.86 | 0.83 |
PSMD10 | 0.86 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.8 | -0.59 | -0.58 |
MT-CO2 | -0.59 | -0.56 |
AF347015.2 | -0.58 | -0.58 |
AF347015.26 | -0.58 | -0.59 |
mt-cyb | -0.58 | -0.58 |
AF347015.33 | -0.57 | -0.57 |
AF347015.15 | -0.57 | -0.58 |
AF347015.18 | -0.54 | -0.57 |
AF347015.27 | -0.54 | -0.55 |
GPT | -0.53 | -0.57 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003851 | 2-羟基酰基肾上腺素1-β-半乳糖基转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0016758 | 转移酶活性,转移己糖基团 | IEA | - | |
去:0008489 | UDP-半乳糖:葡萄糖基酰胺β-1,4-半乳糖基转移酶活性活性 | 塔斯 | 8661025 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007417 | 中枢神经系统发展 | 塔斯 | 大脑(GO期限:6) | 8661025 |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0007422 | 周围神经系统发展 | 塔斯 | 8661025 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg鞘脂代谢 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane乳腺癌ESR1 DN | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG乳腺癌ESR1激光DN | 50 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌B | 48 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王前列腺癌雄激素独立 | 66 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landemaine肺转移 | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt的反应48小时 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krasnoselskaya ILF3靶向DN | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild E2F3致癌特征 | 246 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein少突胶质细胞 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert核心少突胶质细胞分化 | 40 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移DN | 53 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 238 | 244 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-218 | 161 | 168 | 1A,M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |