概括
基因 7376
象征 NR1H2
同义词 lxr-b | lxrb | ner | ner-i | rip15 | unr
描述 核受体亚家族1组成员2
参考 MIM:600380|HGNC:HGNC:7965|ENSEMBL:ENSG00000131408|HPRD:02660|Vega:Otthumg00000183036
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.3
Pascal P值 0.026
Sherlock P值 0.996
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11984825 CHR8 1201727 NR1H2 7376 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Prkra 0.92 0.89
加尔斯 0.91 0.88
ATP1B3 0.91 0.90
法尔斯布 0.91 0.87
UCHL1 0.89 0.85
SLC25A17 0.89 0.89
atxn10 0.89 0.88
VDAC2 0.89 0.88
tor1a 0.89 0.83
Rab11a 0.89 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.81 -0.73
AF347015.8 -0.80 -0.74
AF347015.2 -0.80 -0.75
AF347015.33 -0.79 -0.73
mt-cyb -0.79 -0.73
AF347015.31 -0.78 -0.71
AF347015.26 -0.77 -0.73
AF347015.15 -0.77 -0.72
AF347015.27 -0.77 -0.73
AF347015.21 -0.75 -0.69

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID RXR VDR途径 26 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome核受体转录途径 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM上升 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu Crebbp目标DN 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU基因毒素作用直接与间接4小时 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化的PPARG的LI脂肪生成 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因