基因页:NR1H2
概括?
基因 | 7376 |
象征 | NR1H2 |
同义词 | lxr-b | lxrb | ner | ner-i | rip15 | unr |
描述 | 核受体亚家族1组成员2 |
参考 | MIM:600380|HGNC:HGNC:7965|ENSEMBL:ENSG00000131408|HPRD:02660|Vega:Otthumg00000183036 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.3 |
Pascal P值 | 0.026 |
Sherlock P值 | 0.996 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11984825 | CHR8 | 1201727 | NR1H2 | 7376 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NR1H2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Prkra | 0.92 | 0.89 |
加尔斯 | 0.91 | 0.88 |
ATP1B3 | 0.91 | 0.90 |
法尔斯布 | 0.91 | 0.87 |
UCHL1 | 0.89 | 0.85 |
SLC25A17 | 0.89 | 0.89 |
atxn10 | 0.89 | 0.88 |
VDAC2 | 0.89 | 0.88 |
tor1a | 0.89 | 0.83 |
Rab11a | 0.89 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.81 | -0.73 |
AF347015.8 | -0.80 | -0.74 |
AF347015.2 | -0.80 | -0.75 |
AF347015.33 | -0.79 | -0.73 |
mt-cyb | -0.79 | -0.73 |
AF347015.31 | -0.78 | -0.71 |
AF347015.26 | -0.77 | -0.73 |
AF347015.15 | -0.77 | -0.72 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.73 |
AF347015.21 | -0.75 | -0.69 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID RXR VDR途径 | 26 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome核受体转录途径 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移DN | 161 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM上升 | 81 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu Crebbp目标DN | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU基因毒素作用直接与间接4小时 | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化的PPARG的LI脂肪生成 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |