基因页：USF1

概括？
基因 7391
象征 USF1
同义词 fchl | fchl1 | hyplip1 | mltf | mltfi | uef | bhlhb11
描述 上游转录因子1
参考 MIM：191523|HGNC：HGNC：12593|ENSEMBL：ENSG00000158773|HPRD：01880|Vega：Otthumg0000000031472
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q22-Q23
Sherlock P值 0.951
胎儿β 0.124
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1864549 CHR2 79699410 USF1 7391 1.259E-4 反式
RS10484309 CHR6 117489335 USF1 7391 0.01 反式
RS3798172 CHR6 160556042 USF1 7391 0.07 反式
RS7871241 Chr9 131651203 USF1 7391 0.15 反式
RS17101174 Chr11 103464951 USF1 7391 0.19 反式
RS17070045 CHR13 58400458 USF1 7391 0.02 反式
RS6503212 CHR17 9392733 USF1 7391 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
JDP2 0.80 0.82
CHRD 0.77 0.72
LRRC38 0.77 0.72
TMEM38A 0.76 0.82
necab3 0.76 0.62
itga11 0.75 0.39
FMNL1 0.75 0.70
kcnip3 0.75 0.83
CX3CL1 0.75 0.81
mical2 0.75 0.67
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tubb2b -0.44 -0.60
traf4 -0.44 -0.62
KIAA1949 -0.44 -0.51
COTL1 -0.43 -0.49
AF186192.1 -0.43 -0.60
IDH1 -0.42 -0.51
carhsp1 -0.41 -0.63
LEMD1 -0.41 -0.55
TMC2 -0.41 -0.60
CD24 -0.41 -0.42

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003705 RNA聚合酶II转录因子活性，增强子结合 艾达 2249772
去：0003705 RNA聚合酶II转录因子活性，增强子结合 小鬼 8576131|18234320
去：0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
GO：0043425 BHLH转录因子结合 IPI 8576131
GO：0030528 转录调节器活性 IEA -
GO：0042803 蛋白质同构化活性 IPI 8576131
GO：0042803 蛋白质同构化活性 塔斯 2249772
GO：0046982 蛋白质异二聚化活性 IPI 8576131
GO：0043565 序列特异性DNA结合 艾达 2249772|8576131
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0000432 通过葡萄糖从RNA聚合酶II启动子中转录的正调控 小鬼 7852331
GO：0000432 通过葡萄糖从RNA聚合酶II启动子中转录的正调控 ISS -
去：0001666 对缺氧的反应 小鬼 12917334
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0006366 RNA聚合酶II启动子的转录 艾达 2249772
GO：0010552 从RNA聚合酶II启动子对特异性转录的正调控 小鬼 8576131|18234320
去：0009411 对紫外线的反应 ISS -
GO：0042593 葡萄糖稳态 塔斯 15054483
GO：0019086 晚病毒mRNA转录 艾达 2249772
GO：0045449 转录的调节 IEA -
GO：0055088 脂质稳态 ISS -
GO：0051918 纤维蛋白溶解的阴性调节 我知道了 18234320
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID p38 alpha beta下游途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边结肠癌MSI与MSS UP 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海登布拉德在软组织癌中扩增 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期DN 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma dn 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈肝新陈代谢QTL顺式 93 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因