基因页：vasp
概括？
| 基因 | 7408 |
| 象征 | vasp |
| 同义词 | - |
| 描述 | 血管扩张剂刺激的磷蛋白 |
| 参考 | MIM：601703|HGNC：HGNC：12652|ENSEMBL：ENSG00000125753|HPRD：03415|Vega：Otthumg00000182124 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.32 |
| Pascal P值 | 0.438 |
| Sherlock P值 | 0.101 |
| 胎儿β | -0.322 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10979666 | Chr9 | 111800878 | vasp | 7408 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| GO：0017124 | SH3域结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007411 | 轴突指导 | IEA | Axon（GO期限：13） | - |
| 去：0001843 | 神经管闭合 | IEA | - | |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0030175 | 丝状 | IEA | 轴突（GO术语级别：5） | - |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| GO：0030027 | 薄片 | IEA | - | |
| 去：0005925 | 局灶性粘附 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | 塔斯 | 7828592 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| apbb1ip | inag1 |PREL1 |RARP1 |里亚姆 | 淀粉样β（A4）前体蛋白结合，族B，成员1相互作用蛋白 | - | HPRD | 15469846|15642358 |
| apbb1ip | inag1 |PREL1 |RARP1 |里亚姆 | 淀粉样β（A4）前体蛋白结合，族B，成员1相互作用蛋白 | Riam与VASP互动。 | 绑定 | 15469846 |
| DMRTB1 | - | DMRT样家族B具有富含脯氨酸的C末端，1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| DNMBP | KIAA1010 |图巴 | 动力蛋白结合蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 14506234 |
| ermap | MGC118810 |MGC118811 |MGC118812 |MGC118813 |Pro2801 |RD |sc | 红细胞膜相关蛋白（Scianna血型） | - | HPRD | 15469845 |
| FYB | adap |Pro0823 |Slap-130 | FYN结合蛋白（FYB-120/130） | - | HPRD，Biogrid | 10747096 |
| GSN | DKFZP313L0718 | 凝胶素（淀粉样变性，芬兰类型） | - | HPRD | 11093254 |
| LPP | - | 脂肪瘤中包含首选易位伴侣的LIM结构域 | - | HPRD | 10637295 |
| NOL3 | 弧|卡2 |MYC |myp |nop |NOP30 | 核仁蛋白3（带卡结构域的凋亡抑制剂） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PFN1 | - | profilin 1 | - | HPRD，Biogrid | 10882740 |
| PFN2 | D3S1319E |PFL | profilin 2 | - | HPRD，Biogrid | 7737110|10882740 |
| PLSCR1 | mmtra1b | 磷脂cramblase 1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| RAPH1 | ALS2CR18 |ALS2CR9 |KIAA1681 |LPD |PREL2 |RMO1 |ralgds/af-6 | RAS协会（RALGDS/AF-6）和PLECKSTRIN同源域1 | 重构的复合物 | Biogrid | 15469845 |
| TES | DKFZP586B2022 |MGC1146 |苔丝|苔丝2 | 睾丸衍生的成绩单（3个LIM域） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12695497 |
| TES | DKFZP586B2022 |MGC1146 |苔丝|苔丝2 | 睾丸衍生的成绩单（3个LIM域） | TES与VASP相互作用。 | 绑定 | 12571287 |
| trim9 | KIAA0282 |RNF91 |春天 | 三方基序9 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| vasp | - | 血管扩张剂刺激的磷蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 12220179 |
| VCL | CMD1W |MVCL | Vinculin | - | HPRD，Biogrid | 10882740 |
| 曾是 | IMD2 |THC |黄蜂 | Wiskott-Aldrich综合征（湿疹 - 肉毒细胞减少症） | - | HPRD，Biogrid | 11598004 |
| WWP2 | AIP2 |像WWP2一样 | 含有E3泛素蛋白连接酶2的WW结构域2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| XPO6 | EXP6 |FLJ22519 |KIAA0370 |RANBP20 | 导出6 | - | HPRD，Biogrid | 14592989 |
| Zyx | ESP-2 |hed-2 | Zyxin | - | HPRD | 7644520|10801818 |10851246|10882740 |
| Zyx | ESP-2 |hed-2 | Zyxin | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体外 体内 两个杂交 |
Biogrid | 10801818|10882740 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg fc伽马r介导的吞噬作用 | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rho GTPases对肌动蛋白细胞骨架的SIG调节 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST整合素信号通路 | 82 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin角质形成细胞途径 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL8 CXCR2途径 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin稳定途径 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID凝血酶PAR1途径 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞通信 | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome TCR信号传导 | 54 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome生成第二信使分子 | 27 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Robo受体的反应组信号传导 | 30 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞外基质相互作用 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞连接组织 | 78 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Pou5f1目标 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MA髓样差异化 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kyng DNA损坏紫外线 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜Kras致癌签名 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 335 | 341 | 1a | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
| HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
| mir-204/211 | 412 | 419 | 1A，M8 | HSA-MIR-204脑 | Uucccuuugucauccuaugccu |
| HSA-MIR-211 | uucccuuugucauccuucgccu | ||||
| mir-214 | 180 | 186 | 1a | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
| mir-22 | 499 | 506 | 1A，M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |