基因页：vav2

概括？
基因 7410
象征 vav2
同义词 vav-2
描述 VAV鸟嘌呤核苷酸交换因子2
参考 MIM：600428|HGNC：HGNC：12658|ENSEMBL：ENSG00000160293|HPRD：02694|Vega：Otthumg00000020882
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9q34.1
Pascal P值 0.845
胎儿β 1.983
DMG 2（＃研究）
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG14074652 9 136662289 vav2 5.839E-4 0.276 0.049 DMG：Wockner_2014
CG04582843 9 136857244 vav2 -0.026 0.3 DMG：Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SV2A 0.92 0.92
ENO2 0.91 0.90
PDHX 0.91 0.91
CYFIP2 0.91 0.88
应用程序 0.90 0.89
AP3M2 0.89 0.88
Magee1 0.89 0.89
ATP6AP1 0.89 0.87
DCTN1 0.89 0.86
GPI 0.89 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.58 -0.42
AF347015.18 -0.57 -0.45
AP002478.3 -0.55 -0.51
GNG11 -0.54 -0.44
AC098691.2 -0.54 -0.45
AF347015.2 -0.51 -0.37
AL139819.3 -0.51 -0.46
MT-CO2 -0.51 -0.40
C1orf54 -0.51 -0.45
AF347015.8 -0.51 -0.39

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 CAS-BR-M（鼠）生态逆转录病毒转化序列 - HPRD 11313921
CD19 B4 |MGC12802 CD19分子 - HPRD，Biogrid 11080163
CD44 CDW44 |CSPG8 |ECMR-III |hcell |在|lhr |MC56 |mdu2 |mdu3 |MGC10468 | MIC4 | MUTCH-I | Pgp1 CD44分子（印度血型） - HPRD，Biogrid 11606575
CRK crkii V-CRK肉瘤病毒CT10 ONCOGENE同源物（Avian） CRK与VAV相互作用。 绑定 8621483
egfr ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 表皮生长因子受体（红细胞性白血病病毒（V-ERB-B）癌基因同源物，鸟类） 酪氨酸磷酸化的EGFR与VAV2相互作用并磷酸化。 绑定 12454019
egfr ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 表皮生长因子受体（红细胞性白血病病毒（V-ERB-B）癌基因同源物，鸟类） - HPRD，Biogrid 10618391|10938113
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD，Biogrid 11606575
NEK3 HSPK36 |MGC29949 NIMA（从未在有丝分裂基因A）相关激酶3 VAV2与NEK3相互作用。 绑定 15618286
PDGFRB CD140B |JTK12 |PDGF-R-BETA |PDGFR |PDGFR1 血小板衍生的生长因子受体，β多肽 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10938113
prlr hprlri 催乳素受体 VAV2与PRLR相互作用。 绑定 15618286
Rhoa ARH12 |arha |Rho12 |RHOH12 RAS同源基因家族，成员 - HPRD 11909943
Rhog arhg |MGC125835 |MGC125836 RAS同源基因家族，成员G（Rho G） - HPRD 11909943
SH3BP2 3BP2 |CRBM |CRPM |FLJ42079 |RES4-23 SH3膜结合蛋白2 - HPRD 11390470
SOCS1 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 抑制细胞因子信号传导1 - HPRD，Biogrid 10022833
SOCS1 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 抑制细胞因子信号传导1 SOCS1与VAV2相互作用。这种相互作用是建立在小鼠SOCS1和人VAV2之间的相互作用的模型的。 绑定 10022833


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 137 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg t细胞受体信号通路 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG B细胞受体信号通路 75 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc epsilon ri信号传导途径 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg白细胞跨内皮迁移 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Ptdins途径 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA B细胞受体复合物 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID BCR 5 Pathway 65 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid rhoa reg途径 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID nectin途径 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42途径 70 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42 REG途径 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Ecadherin新生AJ途径 39 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1下游途径 105 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Epha FWDPathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB途径 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPO途径 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Rac1 Reg Pathway 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHA2 FWD途径 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应240 HELA 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特（Smith Tert）目标DN 87 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA髓样分化DN 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
整合素信号传导 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu Crebbp目标DN 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Munshi多发性骨髓瘤 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P4 100 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu肿瘤血管生成 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤DN 26 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta EBNA1反相关 173 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因