SZGR2 - Beplay体育中心

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基因ID	7415
Symbol	VCP
同义词	ALS14 \| CMT2Y \| HEL-220 \| HEL-S-70 \| IBMPFD \| IBMPFD1 \| TERA \| P97
描述	含有蛋白质的瓣膜
参考	MIM：601023\|HGNC：HGNC：12666\|ENSEMBL：ENSG00000165280\|HPRD：03013\|Vega：Otthumg0000000019855
基因类型	蛋白质编码
地图位置	9p13.3
Pascal P值	0.005
Sherlock P值	0.986
主持人	迈尔斯的顺式和跨性别
支持	RNA和蛋白质合成 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP CompositeSet Ascano FMRP目标

基因in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	高通量文献搜索	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS7132043	CHR12	80968399	VCP	7415		0.08		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
MFN2	0.88	0.87
otud5	0.87	0.84
GNL1	0.87	0.85
ALKBH5	0.87	0.86
HDLBP	0.87	0.85
exoc3	0.86	0.83
myst2	0.86	0.85
scrn1	0.85	0.87
diras1	0.85	0.87
SRP68	0.85	0.83

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
AF347015.21	-0.68	-0.55
C1orf54	-0.65	-0.59
FXYD1	-0.63	-0.55
MT-CO2	-0.63	-0.53
higd1b	-0.62	-0.54
鼻孔	-0.61	-0.49
AF347015.31	-0.61	-0.53
AP002478.3	-0.61	-0.54
AF347015.8	-0.60	-0.52
VAMP5	-0.60	-0.50

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
AMFR	GP78 \|RNF45	自分泌运动因子受体	-	HPRD，Biogrid	15331598
atxn3	AT3 \| ATX3 \| JOS \| MJD \| MJD1 \| SCA3	ataxin 3	-	HPRD，Biogrid	12944474
BRCA1	Brcai \|BRCC1 \|虹膜\|PSCP \|RNF53	乳腺癌1，早发	-	HPRD，Biogrid	10855792
CHEK2	CDS1 \|chk2 \|hucds1 \|LFS2 \|pp1425 \|RAD53	CHK2检查点同源物（S. Pombe）	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	17525332
derl1	der-1 \|der1 \|FLJ13784 \|FLJ42092 \|MGC3067 \|Pro2577	der1类域家族，成员1	-	HPRD	15215856
HDAC6	FLJ16239 \|HD6 \|JM21	组蛋白脱乙酰基酶6	-	HPRD	11689694
HLA-B	AS \|HLA-B-7301 \|HLA-B73 \|hlab \|HLAC \|SPDA1	主要的组织相容性复合物，I类，B	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
ikbke	ikk-i \|ikke \|ikki \|KIAA0151 \|MGC125294 \|MGC125295 \|MGC125297	B细胞，激酶Epsilon中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
JAK2	JTK10	Janus激酶2（蛋白酪氨酸激酶）	-	HPRD，Biogrid	11087817
MCC	DKFZP762O1615 \|FLJ38893 \|FLJ46755 \|MCC1	结直肠癌突变	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
NFKBIA	IKBA \| MAD-3 \| NFKBI	B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子	-	HPRD，Biogrid	9452483
NSFL1C	MGC3347 \|ubx1 \|ubxd10 \|ubxn2c \|DJ776F14.1 \|P47	NSFL1（P97）辅因子（P47）	-	HPRD，Biogrid	12529442\|12810701 \| 12810701
NSFL1C	MGC3347 \|ubx1 \|ubxd10 \|ubxn2c \|DJ776F14.1 \|P47	NSFL1（P97）辅因子（P47）	-	HPRD	12810701
PPM1B	MGC21657 \|PP2C-beta-X \| PP2CB \| PP2CBETA \| PPC2BETAX	蛋白质磷酸酶1B（以前为2C），镁依赖性β同工型	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
PSMC1	MGC24583 \|MGC8541 \|P26S4 \|S4 \|p56	蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，1	-	HPRD，Biogrid	9452483
塞尔	AD-015 \|ADO15 \|MGC104346 \|MGC2553 \|sbbi8 \|seps1 \|vimp	硒蛋白	VIMP与P97相互作用。	绑定	15215856
塞尔	AD-015 \|ADO15 \|MGC104346 \|MGC2553 \|sbbi8 \|seps1 \|vimp	硒蛋白	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物	Biogrid	15215856
SGK1	SGK	serum/glucocorticoid regulated kinase 1	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
STX5	sed5 \|STX5A	语法5	-	HPRD	9506515
Tomm34	htom34p \|tom34 \|URCC3	线粒体膜的易位酶34	-	HPRD，Biogrid	11913976
TRAF6	MGC：3310 \|RNF85	TNF受体相关因子6	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
ube4b	E4 \|HDNB1 \|KIAA0684 \|Ubox3 \|UFD2	泛素化因子E4B（UFD2同源物，酵母）	-	HPRD	12504083
VCP	IBMPFD \|MGC131997 \|MGC148092 \|MGC8560 \|tera \|P97	含瓣膜蛋白	-	HPRD，Biogrid	12807884
VCPIP1	DKFZP686G038 \|duba3 \|FLJ23132 \|FLJ60694 \|KIAA1850 \|VCIP135	含有蛋白质（p97）/p47复合蛋白1的瓣膜蛋白1	-	HPRD	12473691
WDR8	FLJ20430 \|MGC99569	WD重复域8	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
casorelli急性临时细胞白血病DN	663	425	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1突变签名1向上	276	165	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3	341	197	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞	530	342	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向DN	1024	594	All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标	795	478	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标	775	494	All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭雷帕霉素反应dn	245	154	All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭谷氨酰胺剥夺DN	337	230	All SZGR 2.0 genes in this pathway
松本自然杀手差分	475	313	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FAELT B CLL WITH VH3 21 UP	44	30	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn	1237	837	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染14小时	156	101	All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和内皮的钟分泌组	66	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组	132	93	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hillion HMGA1目标	90	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HILLION HMGA1B TARGETS	92	68	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE UP	442	263	All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束	1103	714	All SZGR 2.0 genes in this pathway
若林史江脂肪生成PPARG 8 d	658	397	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Alfano MYC目标	239	156	All SZGR 2.0 genes in this pathway
巨噬细胞的库马尔病原体负荷	275	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KUMAR AUTOPHAGY NETWORK	71	46	All SZGR 2.0 genes in this pathway
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标	289	184	All SZGR 2.0 genes in this pathway

基因页：VCP