基因页：VEGFA

概括?
GeneID 7422
Symbol VEGFA
Synonyms MVCD1|VEGF|VPF
描述 血管内皮生长因子A
参考 MIM：192240|HGNC:HGNC:12680|Ensembl:ENSG00000112715|HPRD:01889|Vega:OTTHUMG00000014745
Gene type protein-coding
地图位置 6p12
Pascal p-value 0.071
度p-value DEG：Maycox_2009:CC_BA10_fold_change=1.33:CC_BA10_disease_P=0.0309:HBB_BA9_fold_change=1.23:HBB_BA9_disease_P=0.0369
Fetal beta 1.025
支持 G2Cdb.humanNRC
G2Cdb.humanPSP
Potential synaptic genes

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DEG：Maycox_2009 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 We included 51 genes whose expression changes are common between two schizophrenia cohorts.
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） Psr: 0.04433
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击to show details
GO_Annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
地狱 0.95 0.79
KIF23 0.95 0.75
bub1 0.95 0.83
CCNB2 0.95 0.84
永恒 0.95 0.74
kif4a 0.95 0.83
bub1b 0.95 0.81
FANCI 0.95 0.66
MCM10 0.95 0.81
TPX2 0.95 0.76
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
FBXO2 -0.47 -0.68
HLA-F -0.47 -0.71
ASPHD1 -0.46 -0.66
C5orf53 -0.46 -0.70
SLC9A3R2 -0.46 -0.53
PTH1R -0.45 -0.64
CCNI2 -0.45 -0.67
CA4 -0.45 -0.74
TNFSF12 -0.44 -0.63
LHPP -0.44 -0.62

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0001968 fibronectin binding 艾达 14570917
GO:0005161 platelet-derived growth factor receptor binding IPI 17470632
GO:0008201 heparin binding 艾达 15001987
去：0008083 growth factor activity IEA -
GO：0043184 vascular endothelial growth factor receptor 2 binding IPI 1417831
GO：0042803 protein homodimerization activity ISS -
GO:0043498 cell surface binding 艾达 17470632
GO：0043183 vascular endothelial growth factor receptor 1 binding IPI 1312256
GO：0050840 extracellular matrix binding IC 14570917
Biological process 去term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007399 神经系统的发展 塔斯 neurite (GO term level: 5) 15351965
去：0001570 vasculogenesis 塔斯 15015550
去：0001525 angiogenesis 艾达 11427521
GO:0001666 response to hypoxia 艾达 16490744
去：0002687 positive regulation of leukocyte migration 塔斯 1312256
GO:0001938 内皮细胞增殖的阳性调节 艾达 9202027
GO:0001938 内皮细胞增殖的阳性调节 ISS -
去：0008283 细胞增殖 IEA -
去：0008360 细胞形状调节 艾达 7929439|10527820
GO:0048008 血小板来源的生长因子受体信号通路 艾达 17470632
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0043066 negative regulation of apoptosis 小鬼 10066377|11461089
去：0050930 induction of positive chemotaxis NAS 12744932
GO:0030949 positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway 艾达 1312256|7929439
GO:0043536 血管内皮细胞迁移的阳性调节 艾达 9202027
细胞分量 去term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region EXP 9684805
GO:0005576 extracellular region IEA -
GO:0005578 蛋白质细胞外基质 NAS 14570917
去：0005615 extracellular space 艾达 16490744
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0009986 cell surface 艾达 17470632
GO：0031093 血小板αgranule lumen EXP 9684805

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ADAMTS1 C3-C5 | KIAA1346 | METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 1 ADAMTS1与VEGF165相互作用 绑定 12716911
ADAMTS1 C3-C5 | KIAA1346 | METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 1 Affinity Capture-Western
Co-purification
Reconstituted Complex		 BioGRID 12716911
CTGF CCN2 | HCS24 | IGFBP8 | MGC102839 | NOV2 connective tissue growth factor - HPRD，Biogrid 11744618
FGF5 HBGF-5 |Smag-82 成纤维细胞生长因子5 - HPRD 9323936
FLT1 FLT | VEGFR1 fms-related tyrosine kinase 1 (vascular endothelial growth factor/vascular permeability factor receptor) VEGF165 interacts with Flt-1. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human VEGF165 and Flt-1 from an unspecified species. 绑定 14600159
FLT1 FLT | VEGFR1 fms-related tyrosine kinase 1 (vascular endothelial growth factor/vascular permeability factor receptor) VEGF-A与VEGFR-1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人VEGF-A和VEGFR-1之间的相互作用进行建模的。 绑定 12810700
FLT1 FLT | VEGFR1 fms-related tyrosine kinase 1 (vascular endothelial growth factor/vascular permeability factor receptor) - HPRD 8621427
GPC1 FLJ38078 | glypican Glypican 1 - HPRD，Biogrid 10196157
hif1a HIF-1alpha | HIF1 | HIF1-ALPHA | MOP1 | PASD8 hypoxia-inducible factor 1, alpha subunit (basic helix-loop-helix transcription factor) HIF1A（HIF-1-Alpha）与VEGF启动子相互作用。 绑定 15674338
IGFBP7 FSTL2 | IGFBP-7 | IGFBP-7v | IGFBPRP1 | MAC25 | PSF insulin-like growth factor binding protein 7 - HPRD，Biogrid 12407018
KDR CD309 | FLK1 | VEGFR | VEGFR2 kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) VEGF-A interacts with VEGFR-2. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human VEGF-A and VEGFR-2 from an unspecified species. 绑定 12810700
KDR CD309 | FLK1 | VEGFR | VEGFR2 kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) VEGF165与KDR相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的人VEGF165与KDR之间的相互作用进行建模的。 绑定 14600159
KDR CD309 | FLK1 | VEGFR | VEGFR2 kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) - HPRD 8621427
KDR CD309 | FLK1 | VEGFR | VEGFR2 kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) VEGF与KDR相互作用。 绑定 15542434
KDR CD309 | FLK1 | VEGFR | VEGFR2 kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) Biochemical Activity BioGRID 12716911
NRP1 BDCA4 | CD304 | DKFZp686A03134 | DKFZp781F1414 | NP1 | NRP | VEGF165R neuropilin 1 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 9529250|11986311
NRP1 BDCA4 | CD304 | DKFZp686A03134 | DKFZp781F1414 | NP1 | NRP | VEGF165R neuropilin 1 NRP1与VEGF165相互作用。 绑定 11986311
NRP1 BDCA4 | CD304 | DKFZp686A03134 | DKFZp781F1414 | NP1 | NRP | VEGF165R neuropilin 1 - HPRD 9529250|10409677
|11986311
NRP1 BDCA4 | CD304 | DKFZp686A03134 | DKFZp781F1414 | NP1 | NRP | VEGF165R neuropilin 1 VEGF165与Neuropilin-1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人VEGF165与Neuropilin-1之间的相互作用进行建模的。 绑定 14600159
NRP2 MGC126574 |NP2 |NPN2 |Pro2714 |VEGF165R2 neuropilin 2 - HPRD 10748121
NRP2 MGC126574 |NP2 |NPN2 |Pro2714 |VEGF165R2 neuropilin 2 NP-2与VEGF145相互作用。 绑定 10748121
NRP2 MGC126574 |NP2 |NPN2 |Pro2714 |VEGF165R2 neuropilin 2 NP-2与VEGF165相互作用。 绑定 10748121
PGF D12S1900 |PGFL |PLGF |PLGF-2 |SHGC-10760 placental growth factor - HPRD，Biogrid 12086892|12796773
RB1 OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 retinoblastoma 1 RB1(pRB) interacts with the VEGF promoter. 绑定 15674338
SEMA3F SEMA-IV | SEMA4 | SEMAK SEMA结构域，免疫球蛋白结构域（IG），简短的基本域，分泌，（信号素）3F - HPRD 12845630
SPARC ON secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin) - HPRD，Biogrid 9792673
VEGFA MGC70609 |VEGF |VEGF-A |VPF 血管内皮生长因子A - HPRD，Biogrid 8631822|9207067
VTN V75 | VN | VNT vitronectin - HPRD，Biogrid 11796824


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MTOR SIGNALING PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg vegf信号通路 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肾细胞癌 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胰腺癌 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG BLADDER CANCER 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA NO1 PATHWAY 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA HIF PATHWAY 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta VEGF途径 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN1 PATHWAY 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Glypican 1 Pathway 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF2Pathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Integin3途径 43 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S13途径 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCPTP途径 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P1 PATHWAY 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN A9B1 PATHWAY 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGF VEGFR途径 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 PATHWAY 26 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 2 PATHWAY 69 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1 TFPathway 66 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF HYPOXIA INDUCIBLE FACTOR HIF BY OXYGEN 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME VEGF LIGAND RECEPTOR INTERACTIONS 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧 92 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU PROSTATE CANCER DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 6HR DN 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pramoonjago sox4靶向 52 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASAKI YBX1 TARGETS DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES NTN1 TARGETS DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMIRNOV CIRCULATING ENDOTHELIOCYTES IN CANCER UP 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS RED UP 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEPPER CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIA UP 33 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA UP 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGASHIMA NRG1 SIGNALING UP 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG UP 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PACHER TARGETS OF IGF1 AND IGF2 UP 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION DN 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺DN的反应 84 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BEGUM TARGETS OF PAX3 FOXO1 FUSION DN 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKS HDAC TARGETS DN 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAKER HEMATOPOIESIS STAT3 TARGETS 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RASHI RESPONSE TO IONIZING RADIATION 1 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS LUMINAL 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AGARWAL AKT PATHWAY TARGETS 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OXFORD RALA OR RALB TARGETS DN 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAINA VHL TARGETS DN 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 2 DN 51 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan UV响应正常DN 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hasina NOL7目标DN 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONDO HYPOXIA 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 DN 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA HIF1A DN 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani NFKB目标 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANTOVANI VIRAL GPCR SIGNALING UP 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC UP 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VHL HIF2A DN的Rankin血管生成靶 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HE PTEN TARGETS DN 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应60 HELA 46 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 MCF10A 43 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIPP DLBCL CURED VS FATAL DN 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tenedini Megakaryocyte标记 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO HYPOXIA UP 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱因原发性积液淋巴瘤 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHURINGA STAT5A TARGETS UP 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUO HEX TARGETS UP 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND UP 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAIN NFKB SIGNALING 75 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALAY AML BY NPM1 LOCALIZATION DN 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSE HYPOXIA UP 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED DN 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金缺氧 25 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗感染血巨细胞病毒16人力资源 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS HYPOXIA 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS UP 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伦纳德缺氧 47 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D2 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING NEOCORTEX UP 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV HIGH DOSE DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 2HR 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 1 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Semenza HIF1目标 36 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson FSH响应 9 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TRACEY RESISTANCE TO IFNA2 DN 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS UP 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE AMINO ACID DEPRIVATION 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
coates巨噬细胞M1与M2 DN 78 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE UP 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
podar对Apaphostin的反应 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU TUMOR ANGIOGENESIS UP 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN HOXA5 TARGETS 9HR UP 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI PLASMACYTOMA DN 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI RESPONSE TO RADIATION THERAPY 32 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GU PDEF目标 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mizukami缺氧 12 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN PLASMA CELL VS MATURE B LYMPHOCYTE 67 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED B LYMPHOCYTE 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 11 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 5 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDKN1A通过TP53的WU凋亡 55 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1 TARGETS UP 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI HYPOXIA 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG AR目标DN 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU SKIL TARGETS UP 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANDESLUIS COMMD1 TARGETS GROUP 2 UP 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELPUECH FOXO3 TARGETS DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7目标2 DN 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARDIN HYPOXIA 9 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARDIN HYPOXIA 11 32 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VHL的Wacker缺氧靶标 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RARG BOUND MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-1/206 1445 1451 m8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
HSA-MIR-613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
mir-134 1363 1369 m8 HSA-MIR-134脑 UGUGACUGGUUGACCAGAGGG
mir-139 263 269 1A HSA-MIR-139脑 UCUACAGUGCACGUGUCU
mir-140 997 1003 m8 HSA-MIR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-15/16/195/424/497 211 218 1A，M8 HSA-MIR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15b脑 UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
HSA-MIR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
HSA-MIR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir-150 434 440 m8 HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
miR-17-5p/20/93.mr/106/519.d 112 118 m8 HSA-MIR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-519d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir-185 1635年 1641年 m8 HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-186 360 366 m8 HSA-MIR-186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
mir-199 402 408 1A HSA-MIR-199a cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199b CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC
MiR-200BC/429 1233 1239 m8 HSA-MIR-200B UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-205 85 92 1A，M8 HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug
mir-29 1677年 1684年 1A，M8 hsa-miR-29aSZ UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29bSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
hsa-miR-29cSZ UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir-299-3p 278 285 1A，M8 HSA-MIR-299-3P uauggggaugguaaaaCcgcuu
mir-34/449 778 784 m8 HSA-MIR-34A脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449b Aggcaguguauuguuagcuggc
miR-342 1038 1044 m8 HSA-MIR-342脑 UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUC
mir-34b 779 785 m8 HSA-MIR-34B UAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUG
mir-361 1553年 1560年 1A，M8 hsa-miR-361脑 UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC
mir-377 1037 1043 m8 hsa-miR-377 AUCACACAAAGGCAACUUUUGU
mir-383 1849 1855 m8 hsa-miR-383脑 AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU
miR-410 339 345 1A HSA-MIR-410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
HSA-MIR-410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir-495 1658年 1664年 1A HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 1588年 1594年 1A HSA-MIR-496 AUUACAUGGCCAAUCUC
miR-503 212 218 1A hsa-miR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
miR-543 385 391 1A HSA-MIR-543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 111 117 m8 hsa-miR-93脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
HSA-MIR-302A UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
HSA-MIR-302D UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa-miR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
hsa-miR-373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
HSA-MIR-520E AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
HSA-MIR-520C AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
HSA-MIR-520D AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU