基因页：VIP
概括？
| 基因 | 7432 |
| 象征 | VIP |
| 同义词 | PHM27 |
| 描述 | 血管活性肠肽 |
| 参考 | MIM：192320|HGNC：HGNC：12693|ENSEMBL：ENSG00000146469|HPRD：15950|Vega：Otthumg0000000015851 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q25 |
| Pascal P值 | 0.484 |
| Sherlock P值 | 0.617 |
| 胎儿β | -3.694 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1999829 | CHR6 | 152656214 | VIP | 7432 | 0.2 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| adora2a | 0.94 | -0.23 |
| AC005512.1 | 0.93 | 0.69 |
| rasd2 | 0.92 | 0.56 |
| TMEM90A | 0.90 | 0.29 |
| ADRA2C | 0.90 | 0.49 |
| RGS9 | 0.90 | -0.20 |
| RGS14 | 0.88 | 0.64 |
| 彭克 | 0.88 | 0.02 |
| PTPN7 | 0.88 | 0.23 |
| lingo3 | 0.87 | 0.68 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Blvra | -0.23 | -0.42 |
| STMN1 | -0.23 | -0.57 |
| PGBD1 | -0.22 | -0.60 |
| FAM40A | -0.21 | -0.52 |
| Cabyr | -0.21 | -0.49 |
| ZNF311 | -0.21 | -0.63 |
| ASGR1 | -0.21 | -0.53 |
| tubb2b | -0.20 | -0.64 |
| 塔布 | -0.20 | -0.56 |
| FXYD6 | -0.20 | -0.44 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005184 | 神经肽激素活性 | 塔斯 | 轴突，突触，大脑，神经递质（GO期限：6） | 10096039 |
| 去：0005179 | 激素活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | 塔斯 | 10096039 | |
| 去：0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 塔斯 | 8389448 | |
| 去：0007589 | 体液分泌 | 塔斯 | 4035357 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta VIP途径 | 29 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome B类2 Secralin家族受体 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组胰高血糖素型配体受体 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha的信号事件 | 121 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schramm Inhba目标 | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wotton Runx目标DN | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 182 | 188 | 1a | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-27 | 182 | 189 | 1A，M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-30-5p | 190 | 196 | 1a | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||