基因页面:VIPR2
总结吗?
| GeneID | 7434年 |
| 象征 | VIPR2 |
| 同义词 | C16DUPq36.3 | DUP7q36.3 | PACAP-R-3 | PACAP-R3 | VIP-R-2 | VPAC2 | VPAC2R | VPCAP2R |
| 描述 | ——血管活性肠肽受体2 |
| 参考 | MIM: 601970|HGNC: HGNC: 12695|运用:ENSG00000106018|HPRD: 03576|织女:OTTHUMG00000151446 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 q36.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.601 |
| 胎儿β | -0.515 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 小脑 皮质 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV:是的 | 拷贝数变异的研究 | 人工管理 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg23801272 | 7 | 158824201 | VIPR2 | 3.945的军医 | 0.361 | 0.043 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6979985 | chr7 | 158947293 | VIPR2 | 7434年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs3800270 | chr6 | 151744061 | VIPR2 | 7434年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| OCA2 | 0.79 | 0.45 |
| TMPRSS13 | 0.78 | 0.38 |
| PAPPA2 | 0.78 | 0.48 |
| CDH3 | 0.72 | 0.43 |
| AC010265.1 | 0.72 | 0.56 |
| KIF26A | 0.71 | 0.62 |
| KIAA0182 | 0.71 | 0.39 |
| AL590362.2 | 0.70 | 0.49 |
| STK10 | 0.70 | 0.64 |
| EPB41L4A | 0.70 | 0.49 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ACYP2 | -0.38 | -0.51 |
| C5orf53 | -0.37 | -0.50 |
| DPP7 | -0.37 | -0.33 |
| 组织 | -0.37 | -0.43 |
| TRIM69 | -0.36 | -0.43 |
| ACOT13 | -0.36 | -0.51 |
| CCNI2 | -0.36 | -0.47 |
| PPAP2A | -0.35 | -0.35 |
| CA4 | -0.34 | -0.45 |
| LGI1 | -0.34 | -0.36 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 | 272年 | 195年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA贵宾通道 | 29日 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME B类2分泌素家族受体 | 88年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME胰高糖素配体受体类型 | 33 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME Gα信号事件 | 121年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BORCZUK恶性间皮瘤DN | 104年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 神经胶质瘤ROVERSI拷贝数 | One hundred. | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 高雄应对UVB辐射 | 86年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精子 | 114年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STAMBOLSKY受TP53突变 | 18 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 赞美上帝FOXO3 DN的目标 | 187年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |