概括
基因 744
象征 mpped2
同义词 239fb | c11orf8
描述 含2个的金磷酸酯酶域
参考 MIM:600911|HGNC:HGNC:1180|ENSEMBL:ENSG0000000066382|HPRD:02947|Vega:Otthumg00000166159
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P13
Pascal P值 5.318e-5
Sherlock P值 0.615
胎儿β 1.753
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG17320698 11 30510489 mpped2 2.58e-4 0.529 0.038 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12367145 CHR12 95300075 mpped2 744 0.14 反式
RS7306940 CHR12 95308092 mpped2 744 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 7527372

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与小叶正常 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
grabarczyk bcl11b目标dn 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对雌二醇的反应 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
基础质量靶标 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 1039 1045 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-130/301 1036 1042 M8 HSA-MIR-130A cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-142-5p 1211 1217 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-148/152 1037 1043 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-153 1216 1222 1a HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-19 376 383 1A,M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-218 1065 1071 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-23 21 27 M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-320 656 663 1A,M8 HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-323 21 27 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-34/449 42 48 1a HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-374 57 63 1a HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-384 1159 1165 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-410 747 753 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-448 1215 1222 1A,M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-495 634 640 M8 HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-499 301 307 M8 HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa