基因页:TRPV1
概括?
基因 | 7442 |
象征 | TRPV1 |
同义词 | VR1 |
描述 | 瞬态受体电势阳离子通道亚家族v成员1 |
参考 | MIM:602076|HGNC:HGNC:12716|Ensembl:ENSG00000196689|HPRD:03648|Vega:Otthumg00000177649 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.2 |
Pascal P值 | 0.412 |
DEG P值 | DEG:ZHAO_2015:P = 3.84E-04:Q = 0.0926 |
胎儿β | 1.03 |
主持人 | 小脑 元 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRPV1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPN1 | 0.90 | 0.89 |
PSMD10 | 0.90 | 0.92 |
PPIL1 | 0.89 | 0.88 |
SLC25A17 | 0.87 | 0.88 |
VDAC3 | 0.87 | 0.86 |
mtch2 | 0.87 | 0.90 |
ywhaq | 0.87 | 0.91 |
tusc3 | 0.86 | 0.89 |
CCT5 | 0.86 | 0.90 |
BPGM | 0.86 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.76 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.77 |
AF347015.33 | -0.71 | -0.75 |
AF347015.27 | -0.70 | -0.76 |
mt-cyb | -0.70 | -0.74 |
AF347015.26 | -0.69 | -0.76 |
AF347015.2 | -0.69 | -0.75 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.73 |
AF347015.15 | -0.68 | -0.75 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0005516 | 钙调蛋白结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0005262 | 钙通道活性 | 塔斯 | 9349813 | |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007166 | 细胞表面受体连接的信号转导 | 塔斯 | 9349813 | |
去:0007635 | 化学感觉行为 | 塔斯 | 9349813 | |
去:0006816 | 钙离子传输 | IEA | - | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9349813 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MAPK TRK途径 | 34 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PI3K PLC TRK途径 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |