概括
基因 7442
象征 TRPV1
同义词 VR1
描述 瞬态受体电势阳离子通道亚家族v成员1
参考 MIM:602076|HGNC:HGNC:12716|Ensembl:ENSG00000196689|HPRD:03648|Vega:Otthumg00000177649
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.2
Pascal P值 0.412
DEG P值 DEG:ZHAO_2015:P = 3.84E-04:Q = 0.0926
胎儿β 1.03
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0114

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPN1 0.90 0.89
PSMD10 0.90 0.92
PPIL1 0.89 0.88
SLC25A17 0.87 0.88
VDAC3 0.87 0.86
mtch2 0.87 0.90
ywhaq 0.87 0.91
tusc3 0.86 0.89
CCT5 0.86 0.90
BPGM 0.86 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.73 -0.76
AF347015.8 -0.72 -0.77
AF347015.33 -0.71 -0.75
AF347015.27 -0.70 -0.76
mt-cyb -0.70 -0.74
AF347015.26 -0.69 -0.76
AF347015.2 -0.69 -0.75
AF347015.31 -0.69 -0.73
AF347015.15 -0.68 -0.75
AF347015.21 -0.68 -0.74

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005516 钙调蛋白结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0005262 钙通道活性 塔斯 9349813
去:0005216 离子通道活动 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007166 细胞表面受体连接的信号转导 塔斯 9349813
去:0007635 化学感觉行为 塔斯 9349813
去:0006816 钙离子传输 IEA -
去:0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 9349813

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MAPK TRK途径 34 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3K PLC TRK途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因