概括
基因 7447
象征 VSNL1
同义词 hlp3 | hpcal3 | huvisl1 | vilip | vilip-1
描述 维辛蛋白喜欢1
参考 MIM:600817|HGNC:HGNC:12722|Ensembl:ENSG00000163032|HPRD:02890|Vega:Otthumg0000000090645
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P24.3
Pascal P值 0.028
Sherlock P值 0.204
胎儿β -3.158
主持人 伏隔核基底神经节
支持 细胞内信号转导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
西肾上腺皮质标记DN 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向DN 139 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sabates结直肠腺瘤 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell转移DN 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN 87 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江是衰老下丘脑DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C7的反应 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑中的Smid乳腺癌复发 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G6 UP 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 102 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAT3的Azare肿瘤转化 121 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 555 561 1a HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-103/107 294 300 1a HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-124.1 543 550 1A,M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 543 549 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-148/152 369 375 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-196 120 127 1A,M8 HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-217 601 608 1A,M8 HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-22 53 59 1a HSA-MIR-22 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-23 231 237 M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-323 231 237 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-369-3p 495 501 M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-381 492 498 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-488 576 582 1a HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa