基因页:VSNL1
概括?
基因 | 7447 |
象征 | VSNL1 |
同义词 | hlp3 | hpcal3 | huvisl1 | vilip | vilip-1 |
描述 | 维辛蛋白喜欢1 |
参考 | MIM:600817|HGNC:HGNC:12722|Ensembl:ENSG00000163032|HPRD:02890|Vega:Otthumg0000000090645 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P24.3 |
Pascal P值 | 0.028 |
Sherlock P值 | 0.204 |
胎儿β | -3.158 |
主持人 | 伏隔核基底神经节 |
支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/VSNL1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
西肾上腺皮质标记DN | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向DN | 139 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell转移DN | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN | 87 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江是衰老下丘脑DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Delta FOSB目标2WK | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C7的反应 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑中的Smid乳腺癌复发 | 39 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STAT3的Azare肿瘤转化 | 121 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 555 | 561 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-103/107 | 294 | 300 | 1a | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-124.1 | 543 | 550 | 1A,M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 543 | 549 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-148/152 | 369 | 375 | 1a | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
mir-196 | 120 | 127 | 1A,M8 | HSA-MIR-196A | uagguaguucauguugugug |
HSA-MIR-196B | uagguaguucuuguugg | ||||
mir-217 | 601 | 608 | 1A,M8 | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
mir-22 | 53 | 59 | 1a | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
mir-23 | 231 | 237 | M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-323 | 231 | 237 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
mir-369-3p | 495 | 501 | M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-381 | 492 | 498 | M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
mir-488 | 576 | 582 | 1a | HSA-MIR-488 | cccagauauggcacucucucaa |