基因页:clip2
概括?
基因 | 7461 |
象征 | clip2 |
同义词 | 剪辑|剪辑-115 | cyln2 | wbscr3 | wbscr4 | wscr3 | wscr4 |
描述 | 包含接头蛋白2的帽盖域 |
参考 | MIM:603432|HGNC:HGNC:2586|ENSEMBL:ENSG00000106665|HPRD:09140|Vega:Otthumg0000000022980 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q11.23 |
Pascal P值 | 0.744 |
Sherlock P值 | 0.375 |
胎儿β | -0.182 |
主持人 | 元 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CLIP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
synj1 | 0.91 | 0.91 |
NAPB | 0.91 | 0.93 |
NSF | 0.91 | 0.92 |
REPS2 | 0.91 | 0.86 |
GLS | 0.90 | 0.90 |
B4GALT6 | 0.90 | 0.92 |
NCOA7 | 0.90 | 0.89 |
ATP6V1C1 | 0.90 | 0.88 |
MAP2K4 | 0.90 | 0.88 |
UHMK1 | 0.90 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.46 | -0.50 |
GTF3C6 | -0.41 | -0.36 |
SNHG12 | -0.41 | -0.45 |
NME4 | -0.41 | -0.49 |
C9orf46 | -0.40 | -0.36 |
RPL23A | -0.40 | -0.39 |
C21orf57 | -0.40 | -0.37 |
EFEMP2 | -0.39 | -0.41 |
Rab13 | -0.39 | -0.45 |
AC006276.2 | -0.39 | -0.34 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 | 79 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化6小时 | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
8p缺失DN的Seitz肿瘤转化 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
唱歌转移基质 | 110 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗斯急性髓样白血病CBF | 82 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC vs多能祖先 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML复发预后 | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集9 | 35 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |