基因页：LAT2
概括？
| 基因 | 7462 |
| 象征 | LAT2 |
| 同义词 | HSPC046 | LAB | NTAL | WBSCR15 | WBSCR5 | WSCR5 |
| 描述 | 激活T细胞家族成员2的接头2 |
| 参考 | MIM：605719|HGNC：HGNC：12749|Ensembl：ENSG00000086730|HPRD：09304|Vega：Otthumg00000130151 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q11.23 |
| Pascal P值 | 0.176 |
| Sherlock P值 | 0.777 |
| 胎儿β | -1.266 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS12634640 | CHR3 | 186069564 | LAT2 | 7462 | 0.09 | 反式 | ||
| RS17076272 | CHR13 | 22726361 | LAT2 | 7462 | 0.08 | 反式 | ||
| RS17076274 | CHR13 | 22726381 | LAT2 | 7462 | 0.08 | 反式 | ||
| RS9540668 | CHR13 | 66725232 | LAT2 | 7462 | 0.08 | 反式 | ||
| RS2140736 | CHR15 | 31159211 | LAT2 | 7462 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14722116 | |
| GO：0042169 | SH2域结合 | 小鬼 | 14722116 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0043303 | 肥大细胞脱粒 | IEA | 5-羟色胺（GO期限：9） | - |
| 去：0007242 | 细胞内信号传导级联 | Igi | 14722116 | |
| 去：0006955 | 免疫反应 | IEA | - | |
| GO：0019722 | 钙介导的信号传导 | Igi | 14722116 | |
| GO：0042113 | B细胞激活 | 艾达 | 12514734 | |
| GO：0042113 | B细胞激活 | 塔斯 | 14722116 | |
| GO：0050853 | B细胞受体信号通路 | 艾达 | 12514734 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0045121 | 膜筏 | 艾达 | 12486104|12514734 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID FCER1途径 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应120 HELA | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori大型BII淋巴细胞DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori未成熟B淋巴细胞向上 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗斯急性髓样白血病CBF | 82 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu Crebbp目标DN | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布鲁诺造血 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho茎DN | 74 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SAGIV CD24目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 | 70 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集13 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huang Gata2靶向 | 149 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-155 | 513 | 519 | M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |