基因页：Wnt3
概括？
| 基因 | 7473 |
| 象征 | Wnt3 |
| 同义词 | INT4 | TETAMS |
| 描述 | 无翼型MMTV集成站点家庭成员3 |
| 参考 | MIM：165330|HGNC：HGNC：12782|ENSEMBL：ENSG00000108379|HPRD：01318|Vega：Otthumg00000178076 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17Q21 |
| Pascal P值 | 6.742E-4 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17029291 | CHR3 | 32402138 | Wnt3 | 7473 | 0.13 | 反式 | ||
| RS3933652 | 17 | 44888715 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 4.339E-6 | 0 | 21709 | gtex_brain_ba24 |
| RS3851781 | 17 | 44891301 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 1.044e-6 | 0 | 19123 | gtex_brain_ba24 |
| RS77768380 | 17 | 44891767 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 1.429E-6 | 0 | 18657 | gtex_brain_ba24 |
| RS34724124 | 17 | 44902516 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 3.931E-6 | 0 | 7908 | gtex_brain_ba24 |
| RS11079738 | 17 | 44904049 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 1.656E-6 | 0 | 6375 | gtex_brain_ba24 |
| RS9904865 | 17 | 44908263 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 2.485e-17 | 0 | 2161 | gtex_brain_ba24 |
| RS2165846 | 17 | 44941366 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 2.215E-6 | 0 | -30942 | gtex_brain_ba24 |
| RS60372268 | 17 | 44947756 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 5.087E-6 | 0 | -37332 | gtex_brain_ba24 |
| RS61619946 | 17 | 44947757 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 5.095E-6 | 0 | -37333 | gtex_brain_ba24 |
| RS57986961 | 17 | 44947821 | Wnt3 | ENSG00000108379.5 | 4.932E-6 | 0 | -37397 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PRR11 | 0.89 | 0.62 |
| Hjurp | 0.88 | 0.43 |
| PRC1 | 0.88 | 0.63 |
| GSG2 | 0.88 | 0.55 |
| C15orf42 | 0.88 | 0.56 |
| TPX2 | 0.88 | 0.56 |
| cenpf | 0.88 | 0.58 |
| 地狱 | 0.88 | 0.51 |
| kif2c | 0.87 | 0.50 |
| NCAPH | 0.87 | 0.54 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.36 | -0.52 |
| pth1r | -0.35 | -0.43 |
| ifi27 | -0.35 | -0.52 |
| AF347015.27 | -0.35 | -0.49 |
| MT-CO2 | -0.34 | -0.50 |
| mt-cyb | -0.34 | -0.49 |
| AIFM3 | -0.34 | -0.41 |
| HLA-F | -0.34 | -0.39 |
| FBXO2 | -0.34 | -0.37 |
| SLC9A3R2 | -0.34 | -0.27 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg wnt信号通路 | 151 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg刺猬信号通路 | 56 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg黑色素发生 | 102 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG基底细胞癌 | 55 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wnt信令 | 89 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid wnt信号通路 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome B类2 Secralin家族受体 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hwang前列腺癌标记 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Theodorou乳腺肿瘤发生 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aprelikova BRCA1目标 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 克莱门特乳腺癌复制号码 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |