Summary
GeneID 7476
象征 Wnt7a
同义词 -
描述 无翼型MMTV集成站点家庭成员7a
参考 MIM:601570|HGNC:HGNC:12786|HPRD:03341|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P25
Pascal P值 0.943
Sherlock P值 0.389
胎儿β -0.171
DMG 1(#研究)
主持人 梭子基底神经节

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.006
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 6

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01166979 3 13921889 Wnt7a 5.21E-9 -0.012 2.92E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
rs9870596 3 13216205 Wnt7a ENSG00000154764.5 2.83308E-6 0.04 705413 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005102 受体结合 nas 神经递质(GO期限:4) 8893824
去:0004871 信号传感器活性 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0021707 小脑颗粒细胞分化 IEA 神经元,谷氨酸,大脑(GO期限:15) -
GO:0051965 突触发生的阳性调节 IEA 突触(GO期限:10) -
去:0007269 神经递质分泌 IEA neuron, axon, Synap, serotonin, Neurotransmitter, dopamine (GO term level: 8) -
去:0031133 regulation of axon diameter IEA axon (GO term level: 14) -
GO:0050808 突触组织 IEA 神经元,突触(GO期限:5) -
去:0007223 Wnt受体信号通路,钙调节途径 IEA -
去:0009953 背/腹图形成 IEA -
去:0007165 信号转导 nas 8893824
去:0009653 解剖结构形态发生 塔斯 9161407
去:0007548 性别差异 塔斯 9790192
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
GO:0035115 胚胎前肢形态发生 IEA -
GO:0035116 胚胎后肢形态发生 IEA -
GO:0043589 皮肤形态发生 IEA -
GO:0048705 骨骼系统形态发生 IEA -
GO:0048608 生殖结构的发展 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005578 proteinaceous extracellular matrix IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg wnt信号通路 151 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg刺猬信号通路 56 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG MELANOGENESIS 102 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
癌症中的KEGG途径 328 259 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG基底细胞癌 55 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wnt信令 89 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pid wnt信号通路 28 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GPCR的反应组信号传导 920 449 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome B类2 Secralin家族受体 88 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GPCR配体结合 408 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53目标 1174 695 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应 134 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN 712 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 87 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath PRC2目标 652 441 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
佐藤甲基化沉默的胰腺癌2 50 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MOREIRA RESPONSE TO TSA DN 18 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
佐藤甲基化沉默的胰腺癌1 419 273 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MATZUK IMPLANTATION AND UTERINE 22 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HAN SATB1 TARGETS UP 395 249 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA分泌因素 344 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-137 292 298 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-15/16/195/424/497 197 203 M8 HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-361 312 319 1A,M8 HSA-MIR-361 uuaucagaaucuccagggguac