基因页:XRCC1
概括?
基因 | 7515 |
象征 | XRCC1 |
同义词 | RCC |
描述 | X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复1 |
参考 | MIM:194360|HGNC:HGNC:12828|Ensembl:ENSG00000073050|HPRD:01909|Vega:Otthumg00000182699 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.2 |
Pascal P值 | 0.802 |
Sherlock P值 | 0.851 |
胎儿β | 0.392 |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/XRCC1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003684 | DNA结合受损 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14755728|15044383 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000012 | 单链断裂修复 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005654 | 核质 | 经验 | 8978692 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Apex1 | 猿|ape-1 |APE1 |apen |顶点|APX |hap1 |ref-1 |参考文献1 | 顶点核酸酶(多功能DNA修复酶)1 | - | HPRD,Biogrid | 11707423 |
aptx | aoa |AOA1 |Axa1 |EAOH |eoaha |fha-hit |FLJ20157 |MGC1072 | aprataxin | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 15044383|15555565 |
aptx | aoa |AOA1 |Axa1 |EAOH |eoaha |fha-hit |FLJ20157 |MGC1072 | aprataxin | APTX与XRCC1相互作用。 | 绑定 | 15555565 |
BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1,早发 | - | HPRD | 11352725 |
Lig3 | Lig2 | 连接酶III,DNA,ATP依赖性 | - | HPRD,Biogrid | 8264637|9136882 |9705932|11163244 |
Neil1 | FLJ22402 |FPG1 |nei1 |HFPG1 | NEI核酸内切酶VIII样1(大肠杆菌) | XRCC1与Neil1相互作用。 | 绑定 | 15260972 |
Neil1 | FLJ22402 |FPG1 |nei1 |HFPG1 | NEI核酸内切酶VIII样1(大肠杆菌) | - | HPRD,Biogrid | 15260972 |
OGG1 | 嗯|hogg1 |mutm |OGH1 | 8-氧气的DNA糖基酶 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12933815 |
PARP1 | adprt |adprt1 |PARP |PARP-1 |ppol |PADPRT-1 | 聚(ADP-核糖)聚合酶1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9584196|15044383 |
PARP1 | adprt |adprt1 |PARP |PARP-1 |ppol |PADPRT-1 | 聚(ADP-核糖)聚合酶1 | - | HPRD | 9584196|14500814 |
PARP2 | adprt2 |adprtl2 |adprtl3 |PARP-2 |PADPRT-2 | 聚(ADP-核糖)聚合酶2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11948190 |
PCNA | MGC8367 | 增殖细胞核抗原 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共定位 烦恼 重构的复合物 |
Biogrid | 15107487 |
PNKP | PNK | 多核苷酸激酶3'-磷酸酶 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 远西方 两个杂交 |
Biogrid | 11163244|17353931 |
PNKP | PNK | 多核苷酸激酶3'-磷酸酶 | 磷酸化的XRCC1与PNK相互作用。 | 绑定 | 15066279 |
polb | MGC125976 | 聚合酶(导向DNA),β | - | HPRD,Biogrid | 8978692|11467963 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15044383 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg基础切除修复 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID E2F途径 | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FOXM1途径 | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome碱基切除修复 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AP位点通过单核苷酸替换途径的反应组分辨率 | 12 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1慢性洛夫 | 115 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射3的响应3 | 48 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 8Q24 DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
村上紫外线响应6小时 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson Gamma辐射阻力 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |