概括
基因 7515
象征 XRCC1
同义词 RCC
描述 X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复1
参考 MIM:194360|HGNC:HGNC:12828|Ensembl:ENSG00000073050|HPRD:01909|Vega:Otthumg00000182699
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.802
Sherlock P值 0.851
胎儿β 0.392
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003684 DNA结合受损 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 14755728|15044383
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000012 单链断裂修复 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005654 核质 经验 8978692

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Apex1 猿|ape-1 |APE1 |apen |顶点|APX |hap1 |ref-1 |参考文献1 顶点核酸酶(多功能DNA修复酶)1 - HPRD,Biogrid 11707423
aptx aoa |AOA1 |Axa1 |EAOH |eoaha |fha-hit |FLJ20157 |MGC1072 aprataxin 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 15044383|15555565
aptx aoa |AOA1 |Axa1 |EAOH |eoaha |fha-hit |FLJ20157 |MGC1072 aprataxin APTX与XRCC1相互作用。 绑定 15555565
BRCA1 Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 乳腺癌1,早发 - HPRD 11352725
Lig3 Lig2 连接酶III,DNA,ATP依赖性 - HPRD,Biogrid 8264637|9136882
|9705932|11163244
Neil1 FLJ22402 |FPG1 |nei1 |HFPG1 NEI核酸内切酶VIII样1(大肠杆菌) XRCC1与Neil1相互作用。 绑定 15260972
Neil1 FLJ22402 |FPG1 |nei1 |HFPG1 NEI核酸内切酶VIII样1(大肠杆菌) - HPRD,Biogrid 15260972
OGG1 嗯|hogg1 |mutm |OGH1 8-氧气的DNA糖基酶 重构的复合物
两个杂交
Biogrid 12933815
PARP1 adprt |adprt1 |PARP |PARP-1 |ppol |PADPRT-1 聚(ADP-核糖)聚合酶1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9584196|15044383
PARP1 adprt |adprt1 |PARP |PARP-1 |ppol |PADPRT-1 聚(ADP-核糖)聚合酶1 - HPRD 9584196|14500814
PARP2 adprt2 |adprtl2 |adprtl3 |PARP-2 |PADPRT-2 聚(ADP-核糖)聚合酶2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11948190
PCNA MGC8367 增殖细胞核抗原 亲和力捕获 - 韦斯特恩
共定位
烦恼
重构的复合物
Biogrid 15107487
PNKP PNK 多核苷酸激酶3'-磷酸酶 亲和力捕获ms
亲和力捕获 - 韦斯特恩
远西方
两个杂交
Biogrid 11163244|17353931
PNKP PNK 多核苷酸激酶3'-磷酸酶 磷酸化的XRCC1与PNK相互作用。 绑定 15066279
polb MGC125976 聚合酶(导向DNA),β - HPRD,Biogrid 8978692|11467963
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15044383


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg基础切除修复 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID E2F途径 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXM1途径 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome碱基切除修复 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA修复 112 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AP位点通过单核苷酸替换途径的反应组分辨率 12 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性洛夫 115 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射3的响应3 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heidenblad Amplicon 8Q24 DN 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应6小时 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson Gamma辐射阻力 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因