基因页：YY1

概括?
基因ID 7528
Symbol YY1
同义词 DELTA|INO80S|NF-E1|UCRBP|YIN-YANG-1
描述 YY1转录因子
参考 MIM:600013|HGNC：HGNC：12856|HPRD:02482|
基因type protein-coding
地图位置 14q
Pascal P值 0.501
Sherlock P值 3.053E-4
Fetal beta 0.117
eGene Nucleus accumbens basal ganglia
迈尔斯的顺式和跨性别
Meta

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0278

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs17145698 chrX 40218345 YY1 7528 0.18 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
标记3 0.94 0.95
ZNF280D 0.93 0.94
LEO1 0.93 0.95
ZNF711 0.92 0.95
REV1 0.92 0.94
SCAPER 0.91 0.94
TTC17 0.91 0.93
SR140 0.91 0.94
C10ORF137 0.91 0.94
ZFP28 0.91 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.82 -0.88
MT-CO2 -0.81 -0.88
AF347015.27 -0.81 -0.87
AF347015.33 -0.79 -0.86
FXYD1 -0.79 -0.86
ifi27 -0.79 -0.87
MT-CYB -0.78 -0.85
AF347015.8 -0.78 -0.87
higd1b -0.77 -0.86
HLA-F -0.77 -0.79

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 塔斯 1946405
去：0003713 transcription coactivator activity 塔斯 1946405
去：0003714 转录CorePressor活性 塔斯 1655281
GO:0005515 protein binding 新闻学会 9016636
去：0008270 zinc ion binding 塔斯 1655281
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 1655281
GO:0006350 transcription IEA -
GO:0009952 前/后模式形成 IEA -
GO:0048593 camera-type eye morphogenesis IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005622 intracellular IEA -
GO:0005634 核 IEA -
GO:0005667 transcription factor complex IEA -
GO:0005737 细胞质 艾达 18029348
GO:0005886 质膜 艾达 18029348
GO:0016363 核基质 IEA -
GO:0031519 PcG protein complex IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ATF2 CRE-BP1 |creb2 |HB16 |MGC111558 |Treb7 激活转录因子2 YY1与ATF-2相互作用。 BIND 7769693
ATF6 ATF6A 激活转录因子6 - HPRD，Biogrid 10866666
ATF7 ATFA | MGC57182 激活转录因子7 YY1与ATFA2相互作用。 BIND 7769693
ATF7 ATFA | MGC57182 激活转录因子7 YY1 interacts with ATFa3. BIND 7769693
CDKN2A arf |cdk4i |CDKN2 |CMM2 |ink4 |ink4a |MLM |MTS1 |TP16 |P14 | p14ARF | p16 | p16INK4 | p16INK4a | p19 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2a（黑色素瘤，p16，抑制CDK4） YY1与p14arf相互作用。 BIND 15210108
CREB1 Creb |MGC9284 cAMP responsive element binding protein 1 YY1与Creb相互作用。 BIND 7769693
DNAJB4 DNAJW |DJB4 |HLJ1 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 4 YY1与HLJ1 YY1结合位点相互作用。 BIND 15782117
E2F2 E2F-2 E2F转录因子2 - HPRD 12411495
E2F3 DKFZp686C18211 | E2F-3 | KIAA0075 | MGC104598 E2F转录因子3 - HPRD 12411495
埃德 注意|等待1 embryonic ectoderm development YY1 interacts with EED. BIND 14610174
埃德 注意|等待1 embryonic ectoderm development EED与YY1相互作用。 BIND 11158321
EP300 KAT3B | p300 E1a结合蛋白p300 Affinity Capture-Western
Biochemical Activity
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 7758944|11486036
EZH2 ENX-1 |ezh1 |KMT6 |MGC9169 enhancer of zeste homolog 2 (Drosophila) 埃德interacts with EZH2. BIND 14610174
FKBP1A FKBP-12 |FKBP1 |FKBP12 |FKBP12C |PKC12 |PKCI2 |PPIASE FK506 binding protein 1A, 12kDa 两个杂交 BioGRID 7541038
FKBP3 FKBP-25 |PPIASE FK506 binding protein 3, 25kDa Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 11532945
GTF2I BAP-135 |BAP135 |BTKAP1 |diws |FLJ38776 |FLJ56355 |IB291 |自旋|tfii-i |WBS | WBSCR6 general transcription factor II, i - HPRD 11287625
HDAC1 DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 Reconstituted Complex BioGRID 9346952
HDAC2 RPD3 |YAF1 组蛋白脱乙酰基酶2 YY1 interacts with RPD3. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human YY1 and mouse RPD3. BIND 8917507
HDAC2 RPD3 |YAF1 组蛋白脱乙酰基酶2 - HPRD，Biogrid 11486036
HDAC3 HD3 | RPD3 | RPD3-2 组蛋白脱乙酰基酶3 - HPRD，Biogrid 9346952
KAT2B CAF |P |P/CAF |PCAF K(lysine) acetyltransferase 2B Biochemical Activity BioGRID 11486036
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物（小鼠） YY1与HDM2相互作用。 BIND 15210108
MTA2 DKFZP686F2281 |mta1l1 |pid 转移相关的1个家庭，成员2 Reconstituted Complex BioGRID 12920132
MYC bHLHe39 | c-Myc v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog (avian) - HPRD，Biogrid 8266081
NOTCH1 tan1 |HN1 Notch homolog 1, translocation-associated (Drosophila) - HPRD，Biogrid 12913000
RYBP AAP1 | DEDAF | YEAF1 RING1 and YY1 binding protein - HPRD，Biogrid 10369680
SAP30 - Sin3A-associated protein, 30kDa - HPRD，Biogrid 12788099
SP1 - SP1转录因子 Affinity Capture-Western BioGRID 10224053
SP1 - SP1转录因子 YY1 interacts with Sp1. BIND 8327494
SREBF1 SREBP-1C |SREBP1 |BHLHD1 固醇调节元件结合转录因子1 Reconstituted Complex BioGRID 10224053
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 tumor protein p53 YY1 interacts with p53. BIND 15210108
YAF2 MGC41856 YY1 associated factor 2 - HPRD，Biogrid 9016636
Zranb2 DKFZp686J1831 | DKFZp686N09117 | FLJ41119 | ZIS | ZIS1 | ZIS2 | ZNF265 zinc finger, RAN-binding domain containing 2 - HPRD 11448987


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
PID Notch途径 59 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pidE2F PATHWAY 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pidHDAC CLASSI PATHWAY 66 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pidMTOR 4PATHWAY 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pidP53 REGULATION PATHWAY 59 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid his hey pathway 48 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS DN 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANDRAN METASTASIS TOP50 UP 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 240 HELA 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEOK RESPONSE TO MERCAPTOPURINE AND LD MTX UP 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL WITH VH REARRANGEMENTS DN 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE CALORIE RESTRICTION NEOCORTEX UP 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C2 54 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HENDRICKS SMARCA4 TARGETS DN 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D8 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST STROMAL STIMULATION DN 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 1HR DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAKKER FOXO3 TARGETS DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TNF TARGETS 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yuan Znf143合作伙伴 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-141/200a 669 675 1a hsa-miR-141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-142-5p 296 302 1a hsa-miR-142-5p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
mir-181 789 795 1a hsa-miR-181a脑 aacauucaacgcugucggugagu
hsa-miR-181bSZ aacauucauugcugucggggg
hsa-miR-181c脑 aacauucaaccugucggugagu
hsa-miR-181d脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-186 293 300 1a,m8 hsa-miR-186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
hsa-miR-186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
hsa-miR-186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
mir-29 774 780 m8 hsa-miR-29aSZ uagcaccaucugaaaucgguu
hsa-miR-29bSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
hsa-miR-29cSZ UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir-34/449 720 726 1a HSA-MIR-34A脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
HSA-MIR-34C AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449b Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-381 605 611 1a hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-384 90 96 m8 hsa-miR-384 AUUCCUAGAAAUUGUUCAUA
miR-410 546 553 1a,m8 HSA-MIR-410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
miR-433-3p 269 275 1a HSA-MIR-433脑 AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU