概括
基因 754
象征 pttg1ip
同义词 C21orf1 | C21orf3 | PBF
描述 垂体肿瘤转化1相互作用蛋白
参考 MIM:603784|HGNC:HGNC:13524|ENSEMBL:ENSG00000183255|HPRD:04807|Vega:Otthumg0000000090254
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.3
Pascal P值 0.763
Sherlock P值 0.367
DMG 3(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 3
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 3
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.44

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12121965 21 46293563 pttg1ip 6.58e-5 -0.216 0.024 DMG:Wockner_2014
CG02114786 21 46293672 pttg1ip -0.026 0.31 DMG:Nishioka_2013
CG02114786 21 46293672 pttg1ip 4.24e-11 -0.011 3.83e-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7740200 CHR6 16048563 pttg1ip 754 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SATB2 0.92 0.95
TSPAN14 0.91 0.86
SLA 0.91 0.87
TMEM108 0.90 0.85
TLE3 0.90 0.86
ATXN7L1 0.90 0.85
adra2a 0.89 0.92
TBC1D30 0.89 0.88
Gprin1 0.89 0.89
SOBP 0.89 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
serpinb6 -0.68 -0.76
hepn1 -0.67 -0.75
BDH2 -0.66 -0.80
HSD17B14 -0.66 -0.78
AIFM3 -0.65 -0.75
TSC22D4 -0.65 -0.76
HLA-F -0.64 -0.70
S100B -0.64 -0.80
克鲁 -0.64 -0.68
AP003117.1 -0.63 -0.65

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003674 Molecular_Function nd -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006606 蛋白进口到核中 艾达 10781616
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 10781616
去:0005737 细胞质 艾达 10781616
去:0016020 nas -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成2 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bacolod抗烷基化剂DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁尼trabectedin抗性DN 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索毛毛细胞白血病DN 80 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ellwood Myc Targets DN 40 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 1939年 1946年 1A,M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1938年 1945年 1A,M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC