基因页：ZIC1

概括？
基因 7545
象征 ZIC1
同义词 CRS6 | ZIC | ZNF201
描述 ZIC家庭成员1
参考 MIM：600470|HGNC：HGNC：12872|ENSEMBL：ENSG00000152977|HPRD：02718|Vega：Otthumg00000159456
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q24
Pascal P值 0.001
Sherlock P值 0.69
胎儿β 0.596
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16181396 3 147126206 ZIC1 3.082E-4 0.589 0.04 DMG：Wockner_2014
CG05371578 3 147128157 ZIC1 4.928E-4 0.515 0.047 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 ZIC1 7545 0 反式
RS3845734 CHR2 171125572 ZIC1 7545 0.01 反式
RS7584986 CHR2 184111432 ZIC1 7545 2.006e-5 反式
RS1255634 CHR14 63972654 ZIC1 7545 0.01 反式
RS16955618 CHR15 29937543 ZIC1 7545 1.208E-9 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 塔斯 8542595
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 艾达 大脑（GO期限：7） 8542595
去：0008589 调节平滑信号通路 ISS -
去：0007610 行为 ISS -
去：0007389 模式规范过程 ISS -
去：0030154 细胞分化 IEA -
GO：0042472 内耳形态发生 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005622 细胞内 IEA -
去：0005634 核 艾达 8542595
去：0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 DN 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄端癌症 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌B 48 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关 100 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tesar Alk靶向人类5D 5 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染8小时DN 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
朗布浓缩学习环境迟到 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时DN 101 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Cerebellum标记 85 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TESAR ALK目标Episc 3D UP 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TESAR ALK目标Episc 4d Up 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tesar Alk和Jak靶向鼠标D4 5 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 1893年 1899年 M8 HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-140 841 847 1a HSA-MIR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-15/16/195/424/497 1894年 1900 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 950 956 1a HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-19 1289 1295 1a HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-194 906 912 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-203.1 666 672 M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-214 1160 1166 M8 HSA-MIR-214脑 acagcaggcacagacaggcag
mir-23 577 584 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-299-5p 1464 1470 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-323 577 583 1a HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-346 1976年 1983 1A，M8 HSA-MIR-346脑 ugucugccccgcaugccugccucu
mir-363 660 666 1a HSA-MIR-363 auugcacgguauccaucuguaa
mir-381 651 657 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-409-5p 973 979 M8 HSA-MIR-409-5P Agguacccgagaacuuugca
mir-452 661 668 1A，M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-487b 592 598 M8 HSA-MIR-487B aaucguacagggucauccacuu
mir-493-5p 1530 1536年 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-494 709 715 1a HSA-MIR-494脑 ugaaacauacgggaaaccucuu
mir-496 883 890 1A，M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-539 1719年 1726年 1A，M8 HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-543 552 558 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu