基因页面:ZNF12
总结吗?
| GeneID | 7559年 |
| 象征 | ZNF12 |
| 同义词 | GIOT-3 | HZF11 | KOX3 | ZNF325 |
| 描述 | 锌指蛋白12 |
| 参考 | MIM: 194536|HGNC: HGNC: 12902|运用:ENSG00000164631|HPRD: 11835|HPRD: 15773|织女:OTTHUMG00000151910 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 p22 . 1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.004 |
| 夏洛克假定值 | 0.401 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.595 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | ZNF12 | 7559年 | 0 | 反式 | ||
| rs12509866 | chr4 | 173017639 | ZNF12 | 7559年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs7076439 | chr10 | 93286841 | ZNF12 | 7559年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs11186601 | chr10 | 93287199 | ZNF12 | 7559年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | ZNF12 | 7559年 | 3.03的军医 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003676 | 核酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌导管和基地 | 380年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过小道HAMAI细胞凋亡 | 584年 | 356年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 《图片报》SRC致癌签名 | 62年 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DUTERTRE雌二醇响应24小时DN | 505年 | 328年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-26 | 1884年 | 1890年 | 1 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir - 346 | 1110年 | 1117年 | 1、m8 | hsa - mir - 346大脑 | UGUCUGCCCGCAUGCCUGCCUCU |