基因页:MZF1
概括?
基因 | 7593 |
象征 | MZF1 |
同义词 | MZF-1 | MZF1B | ZFP98 | ZNF42 | ZSCAN66 |
描述 | 髓样锌指1 |
参考 | MIM:194550|HGNC:HGNC:13108|Ensembl:ENSG0000000099326|HPRD:01930|Vega:Otthumg00000183550 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.4 |
Pascal P值 | 0.003 |
Sherlock P值 | 0.507 |
胎儿β | 0.225 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02765403 | 19 | 59075349 | MZF1; LOC100131691 | 9.58e-5 | 0.246 | 0.027 | DMG:Wockner_2014 |
CG11446693 | 19 | 59074994 | MZF1; LOC100131691 | 3.049E-4 | 0.307 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
CG11707067 | 19 | 59073430 | MZF1; LOC100131691 | 4.4e-4 | 0.418 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | MZF1 | 7593 | 0.04 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | MZF1 | 7593 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MZF1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BCR ABL1融合的klein目标 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 12P11 12 DN | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化DN沉默 | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |