基因页:CA4
概括?
基因 | 762 |
象征 | CA4 |
同义词 | CAIV | CAR4 | RP17 |
描述 | 碳赤霉素IV |
参考 | MIM:114760|HGNC:HGNC:1375|ENSEMBL:ENSG00000167434|HPRD:00261|Vega:Otthumg00000179987 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q23 |
Pascal P值 | 0.063 |
Sherlock P值 | 9.933e-4 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | CA4 | 762 | 5.199E-4 | 反式 | ||
RS3747518 | CHR2 | 163128724 | CA4 | 762 | 0.18 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | CA4 | 762 | 0.02 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | CA4 | 762 | 0.01 | 反式 | ||
RS1380396 | CHR5 | 100737044 | CA4 | 762 | 0.05 | 反式 | ||
RS6887062 | CHR5 | 123850762 | CA4 | 762 | 0.1 | 反式 | ||
RS4075663 | Chr11 | 18793398 | CA4 | 762 | 0.19 | 反式 | ||
RS4265582 | Chr11 | 18797649 | CA4 | 762 | 0.18 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CA4 | 762 | 5.484e-6 | 反式 | ||
RS16996066 | CHR20 | 50135843 | CA4 | 762 | 0.14 | 反式 | ||
RS5977910 | Chrx | 132901292 | CA4 | 762 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CA4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TUBG2 | 0.86 | 0.86 |
Thy1 | 0.86 | 0.75 |
加布德 | 0.85 | 0.90 |
GLS2 | 0.85 | 0.76 |
got1 | 0.85 | 0.73 |
TMEM38A | 0.84 | 0.86 |
ABTB1 | 0.84 | 0.83 |
itpka | 0.84 | 0.87 |
extl1 | 0.83 | 0.86 |
clec2l | 0.83 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA1949 | -0.61 | -0.67 |
tubb2b | -0.61 | -0.74 |
SH3BP2 | -0.59 | -0.73 |
ZNF311 | -0.58 | -0.63 |
FADS2 | -0.58 | -0.66 |
YBX1 | -0.58 | -0.68 |
DPYSL3 | -0.57 | -0.57 |
marcksl1 | -0.57 | -0.63 |
PKN1 | -0.57 | -0.66 |
IDH1 | -0.57 | -0.65 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氮代谢 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG近端小管碳酸氢盐开垦 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
二氧化碳的反应可逆水合 | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制肌肉 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞DN | 216 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Demagalhaes老化DN | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标4 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Madan DPPA4目标 | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman泼尼松龙抗性B全部DN | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman泼尼松龙抗性所有DN | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |