概括
基因 762
象征 CA4
同义词 CAIV | CAR4 | RP17
描述 碳赤霉素IV
参考 MIM:114760|HGNC:HGNC:1375|ENSEMBL:ENSG00000167434|HPRD:00261|Vega:Otthumg00000179987
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q23
Pascal P值 0.063
Sherlock P值 9.933e-4
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 CA4 762 5.199E-4 反式
RS3747518 CHR2 163128724 CA4 762 0.18 反式
RS3845734 CHR2 171125572 CA4 762 0.02 反式
RS17762315 CHR5 76807576 CA4 762 0.01 反式
RS1380396 CHR5 100737044 CA4 762 0.05 反式
RS6887062 CHR5 123850762 CA4 762 0.1 反式
RS4075663 Chr11 18793398 CA4 762 0.19 反式
RS4265582 Chr11 18797649 CA4 762 0.18 反式
RS16955618 CHR15 29937543 CA4 762 5.484e-6 反式
RS16996066 CHR20 50135843 CA4 762 0.14 反式
RS5977910 Chrx 132901292 CA4 762 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TUBG2 0.86 0.86
Thy1 0.86 0.75
加布德 0.85 0.90
GLS2 0.85 0.76
got1 0.85 0.73
TMEM38A 0.84 0.86
ABTB1 0.84 0.83
itpka 0.84 0.87
extl1 0.83 0.86
clec2l 0.83 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1949 -0.61 -0.67
tubb2b -0.61 -0.74
SH3BP2 -0.59 -0.73
ZNF311 -0.58 -0.63
FADS2 -0.58 -0.66
YBX1 -0.58 -0.68
DPYSL3 -0.57 -0.57
marcksl1 -0.57 -0.63
PKN1 -0.57 -0.66
IDH1 -0.57 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氮代谢 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG近端小管碳酸氢盐开垦 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
二氧化碳的反应可逆水合 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Demagalhaes老化DN 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标4 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Madan DPPA4目标 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman泼尼松龙抗性B全部DN 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman泼尼松龙抗性所有DN 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因