基因页：CA5A

概括？
基因 763
象征 CA5A
同义词 Ca5 | Ca5ad | Cav | Cava | GS1-21A4.1
描述 碳赤霉素VA，线粒体
参考 MIM：114761|HGNC：HGNC：1377|HPRD：00262|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q24.3
Pascal P值 0.095
胎儿β -0.276
DMG 1（＃研究）
主持人 尾状基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG02472906 16 87938341 CA5A 4.66E-4 0.198 0.046 DMG：Wockner_2014
CG07544223 16 87965360 CA5A 5.88e-4 -0.592 0.05 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS13380772 16 87906337 CA5A ENSG00000174990.3 6.364e-7 0.01 63798 gtex_brain_putamen_basal
RS35367472 16 87913607 CA5A ENSG00000174990.3 2.535E-7 0.01 56528 gtex_brain_putamen_basal
RS59361827 16 87916688 CA5A ENSG00000174990.3 2.619E-7 0.01 53447 gtex_brain_putamen_basal
RS7498257 16 87919461 CA5A ENSG00000174990.3 2.819E-7 0.01 50674 gtex_brain_putamen_basal
RS4843275 16 87920548 CA5A ENSG00000174990.3 1.812E-7 0.01 49587 gtex_brain_putamen_basal
RS4843728 16 87921399 CA5A ENSG00000174990.3 2.792E-7 0.01 48736 gtex_brain_putamen_basal
RS61607056 16 87921607 CA5A ENSG00000174990.3 2.789E-7 0.01 48528 gtex_brain_putamen_basal
RS7203884 16 87923358 CA5A ENSG00000174990.3 4.676E-7 0.01 46777 gtex_brain_putamen_basal
RS11859896 16 87925260 CA5A ENSG00000174990.3 8.264e-7 0.01 44875 gtex_brain_putamen_basal
RS56768079 16 87930258 CA5A ENSG00000174990.3 3.375E-7 0.01 39877 gtex_brain_putamen_basal
RS55883615 16 87931142 CA5A ENSG00000174990.3 2.923E-7 0.01 38993 gtex_brain_putamen_basal
RS8058389 16 87931281 CA5A ENSG00000174990.3 5.841E-7 0.01 38854 gtex_brain_putamen_basal
RS397737528 16 87936356 CA5A ENSG00000174990.3 4.181E-7 0.01 33779 gtex_brain_putamen_basal
RS4843732 16 87939470 CA5A ENSG00000174990.3 2.967E-8 0.01 30665 gtex_brain_putamen_basal
RS8048719 16 87942424 CA5A ENSG00000174990.3 7.858e-8 0.01 27711 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
inpp4b 0.67 0.68
DDAH1 0.66 0.67
毛阿 0.66 0.65
BCKDHB 0.65 0.69
PRCP 0.65 0.65
TMEM22 0.64 0.62
vwa5a 0.64 0.65
TSPAN33 0.64 0.70
ATPAF1 0.64 0.68
b3galtl 0.63 0.64
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DOK5 -0.40 -0.16
PCSK9 -0.37 -0.31
LPL -0.36 -0.17
Edaradd -0.36 -0.32
TSPO -0.36 -0.34
AC005921.3 -0.36 -0.46
LHX2 -0.35 -0.26
FABP7 -0.35 -0.36
RBMX2 -0.35 -0.40
UPF3A -0.34 -0.36

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG氮代谢 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
二氧化碳的反应可逆水合 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对Bexarotene的反应 34 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon 53 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌电纤维酸DN 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc TGFA DN 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌DN 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖DN 179 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Woo肝癌复发DN 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因