基因页：ZNF84
概括？
| 基因 | 7637 |
| 象征 | ZNF84 |
| 同义词 | HPF2 |
| 描述 | 锌指蛋白84 |
| 参考 | HGNC：HGNC：13159|ENSEMBL：ENSG00000198040|HPRD：15891|Vega：Otthumg00000167939 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12Q24.33 |
| Pascal P值 | 0.057 |
| 胎儿β | 2.298 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG27363310 | 12 | 133613924 | ZNF84 | 1.76E-8 | -0.008 | 6.36E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6560918 | CHR12 | 133619018 | ZNF84 | 7637 | 0.2 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RCOR2 | 0.88 | 0.80 |
| CD276 | 0.87 | 0.86 |
| th1l | 0.86 | 0.85 |
| ATP7B | 0.86 | 0.85 |
| DLG5 | 0.86 | 0.87 |
| Znf71 | 0.86 | 0.85 |
| H3F3B | 0.86 | 0.85 |
| EPHB2 | 0.86 | 0.85 |
| NUP188 | 0.86 | 0.86 |
| C2orf68 | 0.86 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.66 | -0.74 |
| AF347015.27 | -0.65 | -0.81 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.80 |
| MT-CO2 | -0.64 | -0.79 |
| AF347015.33 | -0.63 | -0.78 |
| FXYD1 | -0.63 | -0.78 |
| HLA-F | -0.63 | -0.70 |
| ifi27 | -0.63 | -0.77 |
| COPZ2 | -0.63 | -0.72 |
| Cox4i2 | -0.61 | -0.75 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血祖先DN | 66 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王前列腺癌雄激素独立 | 66 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CDKN1A通过TP53的WU凋亡 | 55 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇2向上 | 54 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇7 | 118 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |