基因页:ZNF134
概括?
基因 | 7693 |
象征 | ZNF134 |
同义词 | PHZ-15 |
描述 | 锌指蛋白134 |
参考 | MIM:604076|HGNC:HGNC:12918|HPRD:07241| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.4 |
Pascal P值 | 0.48 |
Sherlock P值 | 0.113 |
DMG | 1(#研究) |
耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG16644177 | 19 | 58125438 | ZNF134 | 5.17e-8 | -0.012 | 1.36E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1570589 | CHR9 | 116874354 | ZNF134 | 7693 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF134_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
polr1d | 0.92 | 0.93 |
IGBP1 | 0.91 | 0.91 |
SIRT4 | 0.91 | 0.86 |
VPS72 | 0.91 | 0.93 |
CCT3 | 0.90 | 0.91 |
PQBP1 | 0.90 | 0.91 |
CCT7 | 0.90 | 0.92 |
MRPL45 | 0.89 | 0.89 |
ALKBH2 | 0.89 | 0.89 |
CCT4 | 0.89 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.81 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.79 |
AF347015.27 | -0.67 | -0.80 |
mt-cyb | -0.67 | -0.80 |
AF347015.8 | -0.67 | -0.80 |
AF347015.26 | -0.67 | -0.83 |
AF347015.2 | -0.67 | -0.83 |
AF347015.15 | -0.67 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.77 |
HLA-F | -0.65 | -0.76 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨型性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra靶向DN | 105 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 | 120 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC绑定的Dang | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一个EGF脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔 | 105 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |