概括
GeneID 7704
Symbol ZBTB16
同义词 PLZF | ZNF145
描述 锌指和包含16的BTB结构域
参考 MIM:176797|HGNC:HGNC:12930|Ensembl:ENSG00000109906|HPRD:11762|Vega:Otthumg00000168243
基因类型 蛋白质编码
Map location 11q23.1
pascal p-value 0.733
Sherlock P值 0.64
胎儿β -2.017
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006
表达 基因表达的荟萃分析 pvalue: 2.137
GO_Annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

probe 染色体 位置 Nearest gene p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
cg07673133 11 113930011 ZBTB16 1.22E-8 -0.015 4.99E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene pearson's Correlation Spearman's Correlation
DDX5 0.96 0.94
ZNF285B 0.95 0.91
UIMC1 0.95 0.88
C1orf26 0.95 0.93
CEP57 0.95 0.93
HSF2 0.94 0.93
ZCCHC7 0.94 0.94
ZNF586 0.94 0.88
WTAP 0.94 0.94
Tex10 0.94 0.91
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene pearson's Correlation Spearman's Correlation
HLA-F -0.71 -0.80
AIFM3 -0.70 -0.79
AF347015.31 -0.69 -0.87
AF347015.27 -0.69 -0.86
MT-CO2 -0.68 -0.87
FBXO2 -0.68 -0.70
pth1r -0.68 -0.74
C5orf53 -0.67 -0.72
IFI27 -0.67 -0.86
mt-cyb -0.67 -0.86

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 pubMed ID
去:0003677 DNA binding nas 9294197
GO:0008270 zinc ion binding IEA -
GO:0016566 特定的转录阻遏活性 IDA 12802276
GO:0042803 蛋白质同构化活性 IDA 8622986
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 pubMed ID
去:0007417 中枢神经系统发展 ISS 大脑(GO期限:6) 8541544
GO:0001823 中源开发 ISS 8541544
GO:0006350 转录 IEA -
去:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process IEA -
去:0006915 apoptosis nas 9294197
GO:0045638 髓样细胞分化的负调控 ISS 8541544
GO:0045892 negative regulation of transcription, DNA-dependent IDA 12802276
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 pubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IDA 9294197
去:0005730 nucleolus IDA 18029348
GO:0016607 nuclear speck IDA 8541544
GO:0016605 pML body IDA 9294197
GO:0017053 转录阻遏物复合物 IDA 12802276

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 pubMed ID
Agtr1 AG2S | AGTR1A | AGTR1B | AT1 | AT1B | AT1R | AT2R1 | AT2R1A | AT2R1B | HAT1R 血管紧张素II受体,1型 重构的复合物
两个杂交
Biogrid 14657020
Agtr2 AT2 | ATGR2 | MRX88 血管紧张素II受体,2型 - HPRD 14657020
ANAPC5 APC5 后期促进复合物亚基5 两个杂交 Biogrid 16169070
Bcl6 BCL5 | BCL6A | LAZ3 | ZBTB27 | ZNF51 B细胞CLL/淋巴瘤6 - HPRD,Biogrid 11175338
BMI1 MGC12685 | PCGF4 | RNF51 BMI1 Polycomb环形指癌基因 - HPRD,Biogrid 12408802
CCDC109B FLJ20647 coiled-coil domain containing 109B 两个杂交 Biogrid 16169070
CCDC130 MGC10471 包含130 两个杂交 Biogrid 16169070
CCDC85B dipa coiled-coil domain containing 85B 两个杂交 Biogrid 16189514
CD81 S5.7 | TAPA1 | TSPAN28 CD81分子 两个杂交 Biogrid 16169070
CDC2 cdc28a |CDK1 |DKFZP686L20222 |MGC111195 cell division cycle 2, G1 to S and G2 to M - HPRD,Biogrid 10497277
CEP70 咬|FLJ13036 centrosomal protein 70kDa 两个杂交 Biogrid 16189514
CEP72 FLJ10565 |KIAA1519 |MGC5307 centrosomal protein 72kDa 两个杂交 Biogrid 16189514
CIDEA CIDE-A 细胞死亡诱导DFFA样效应子A 两个杂交 Biogrid 16169070
COQ6 CGI-10 辅酶Q6同源物,单加氧酶(S. cerevisiae) 两个杂交 Biogrid 16169070
dlst DLTS 二氢丙酰胺S-核转移酶(2-氧基 - 谷氨酸酯配合物的E2成分) 两个杂交 Biogrid 16169070
DPM1 CDGIE | MPDS dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 1, catalytic subunit 两个杂交 Biogrid 16169070
EIF2S2 DKFZp686L18198 | EIF2 | EIF2B | EIF2beta | MGC8508 真核翻译起始因子2,亚基2β,38KDA 两个杂交 Biogrid 16169070
ENOX1 CNOX | FLJ10094 | PIG38 | bA64J21.1 | cCNOX Ecto-Nod二硫键 - 硫醇交换器1 两个杂交 Biogrid 16189514
EPN1 - Epsin 1 - HPRD 10791968
ESR1 DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 雌激素受体1 - HPRD,Biogrid 14521715
FAM101B MGC45871 family with sequence similarity 101, member B 两个杂交 Biogrid 16169070
FCHO1 KIAA0290 FCH domain only 1 两个杂交 Biogrid 16169070
FHL2 AAG11 |Dral |Slim3 four and a half LIM domains 2 - HPRD,Biogrid 12145280
GATA1 ERYF1 |GF-1 |GF1 |NFE1 GATA结合蛋白1(球蛋白转录因子1) - HPRD,Biogrid 12242665
GATA2 MGC2306 | NFE1B GATA binding protein 2 - HPRD,Biogrid 11964310
GCSH GCE | NKH 甘氨酸切割系统蛋白H(氨基甲基载体) 两个杂交 Biogrid 16169070
GSTM4 GSTM4-4 |GTM4 |MGC131945 |MGC9247 谷胱甘肽S-转移酶MU 4 两个杂交 Biogrid 16169070
HBEGF DTR | DTS | DTSF | HEGFL 肝素结合EGF样生长因子 - HPRD,Biogrid 14597771|15219838
hbxip MGC71071 | XIP hepatitis B virus x interacting protein 两个杂交 Biogrid 16169070
HDAC1 DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 - HPRD 9627120|15467736
HDAC1 DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 9627120|9765306
|15467736
HDAC1 DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 HDAC1 interacts with PLZF. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between HDAC1 and PLZF from unspecified species. 绑定 9486654
HDAC2 RPD3 |yaf1 组蛋白脱乙酰基酶2 重构的复合物 Biogrid 15467736
HDAC3 HD3 |RPD3 |RPD3-2 组蛋白脱乙酰基酶3 重构的复合物 Biogrid 15467736
HDAC4 HA6116 |HD4 |HDAC-A |hdaca |KIAA0288 组蛋白脱乙酰基酶4 - HPRD,Biogrid 11929873|15467736
HDAC5 FLJ90614 |HD5 |NY-CO-9 组蛋白脱乙酰基酶5 - HPRD,Biogrid 11929873|15467736
HDAC6 FLJ16239 |HD6 |JM21 组蛋白脱乙酰基酶6 - HPRD,Biogrid 15467736
HDAC7 DKFZP586J0917 |FLJ99588 |HD7A |HDAC7A 组蛋白脱乙酰基酶7 重构的复合物 Biogrid 11929873
HDAC9 DKFZp779K1053 | HD7 | HDAC | HDAC7 | HDAC7B | HDAC9B | HDAC9FL | HDRP | KIAA0744 | MITR 组蛋白脱乙酰基酶9 - HPRD 12590135
HEATR2 FLJ20397 |FLJ25564 |FLJ31671 |FLJ39381 加热重复包含2 两个杂交 Biogrid 16169070
KRTAP4-12 KAP4.12 | KRTAP4.12 角蛋白相关蛋白4-12 两个杂交 Biogrid 16189514
LDOC1 BCUR1 | Mar7 | Mart7 亮氨酸拉链,在癌症中下调1 两个杂交 Biogrid 16189514
LMTK3 KIAA1883 | LMR3 | TYKLM3 狐猴酪氨酸激酶3 两个杂交 Biogrid 16169070
LSM2 C6orf28 |g7b |YBL026W |snrnp LSM2同源物,U6小核RNA相关(酿酒酵母) 两个杂交 Biogrid 16169070
LYAR FLJ20425 | ZLYAR LY1抗体反应性同源物(小鼠) 两个杂交 Biogrid 16169070
Magea11 法师11 |Mage11 |magea-11 |MGC10511 melanoma antigen family A, 11 两个杂交 Biogrid 16189514
MAP3K3 MAPKKK3 |mekk3 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶3 两个杂交 Biogrid 16169070
NCOR1 KIAA1047 |MGC104216 |n-cor |trac1 |HCIT529I10 |hn-cor 核受体共抑制剂1 - HPRD,Biogrid 9531570
NCOR2 CTG26 | SMRT | SMRTE | SMRTE-tau | TNRC14 | TRAC-1 | TRAC1 核受体共抑制剂2 - HPRD 9256429|14982881
NCOR2 CTG26 | SMRT | SMRTE | SMRTE-tau | TNRC14 | TRAC-1 | TRAC1 核受体共抑制剂2 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9256429|9765306
|14982881
NCOR2 CTG26 | SMRT | SMRTE | SMRTE-tau | TNRC14 | TRAC-1 | TRAC1 核受体共抑制剂2 SMRT与PLZF相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的SMRT和PLZF之间的相互作用进行建模的。 绑定 9486654
NR3C1 GCCR |GCR |gr |grl 核受体亚科3,C组,成员1(糖皮质激素受体) - HPRD,Biogrid 14521715
pafah1b3 - platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, gamma subunit 29kDa 两个杂交 Biogrid 16169070
PGAM5 BXLBv68 | MGC5352 磷酸甘油酸突变酶家族成员5 两个杂交 Biogrid 16169070
PLSCR1 mmtra1b 磷脂cramblase 1 两个杂交 Biogrid 16189514
PMAIP1 APR | NOXA phorbol-12-催眠13-乙酸盐诱导的蛋白质1 两个杂交 Biogrid 16169070
pML MYL | PP8675 | RNF71 | TRIM19 promyelocytic leukemia - HPRD,Biogrid 9294197|11175338
PSMD11 MGC3844 | Rpn6 | S9 | p44.5 蛋白酶体(prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 11 两个杂交 Biogrid 16169070
PSMD2 MGC14274 |P97 |rpn1 |S2 |陷阱2 蛋白酶体(prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 2 两个杂交 Biogrid 16169070
QTRT1 FP3235 | TGT Queuine tRNA-核糖基转移酶1 两个杂交 Biogrid 16169070
RAB27A GS2 | HsT18676 | MGC117246 | RAB27 | RAM RAB27A, member RAS oncogene family 两个杂交 Biogrid 16169070
拉拉 NR1B1 | RAR retinoic acid receptor, alpha - HPRD,Biogrid 14521715
RB1 OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 retinoblastoma 1 pRB interacts with PLZF. 绑定 15949438
runx1t1 AML1T1 |CBFA2T1 |CDR |Eto |MGC2796 |mtg8 |mtg8b |zmynd2 与RUNT相关的转录因子1;易位为1(Cyclin D相关) - HPRD,Biogrid 10688654|11090081
RXRA FLJ00280 |FLJ00318 |FLJ16020 |FLJ16733 |MGC102720 |NR2B1 retinoid X receptor, alpha - HPRD 8622986
sin3a DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) - HPRD 9627120|11719366
sin3a DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9627120|9765306
|11719366
sin3a DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) SIN3A与PLZF相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的MSIN3A和PLZF之间的相互作用进行建模的。 绑定 9486654
SIN3B KIAA0700 SIN3同源物B,转录调节剂(酵母) - HPRD,Biogrid 9627120
SP1 - Sp1 transcription factor - HPRD 12004059
汤匙 TEF2 斑点型POZ蛋白 两个杂交 Biogrid 16189514
terf1 FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 telomeric repeat binding factor (NIMA-interacting) 1 两个杂交 Biogrid 16169070
thnsl2 FLJ10916 | THS2 | TSH2 苏氨酸合酶样2(酿酒酵母) 两个杂交 Biogrid 16169070
Tollip FLJ33531 |IL-1RACPIP toll interacting protein 两个杂交 Biogrid 16169070
TRAF2 MGC:45012 |陷阱|陷阱3 TNF receptor-associated factor 2 两个杂交 Biogrid 16189514
TRIM27 RFP |RNF76 三方基序27 两个杂交 Biogrid 16189514
txnip EST01027 |HHCPA78 |thif |VDUP1 硫氧还蛋白相互作用的蛋白 - HPRD,Biogrid 12821938
VDR NR1I1 vitamin D (1,25- dihydroxyvitamin D3) receptor - HPRD,Biogrid 11719366|12460926
|14521715
VTA1 C6orf55 | DRG-1 | DRG1 | FLJ27228 | HSPC228 | LIP5 | My012 | SBP1 Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae) 两个杂交 Biogrid 16189514
WDR33 FLJ11294 | WDC146 WD重复域33 两个杂交 Biogrid 16169070
ZBTB16 pLZF | ZNF145 锌指和包含16的BTB结构域 - HPRD,Biogrid 8622986
ZBTB32 FAXF | FAZF | Rog | TZFP | ZNF538 锌指和包含32的BTB结构域 - HPRD,Biogrid 10572087
ZNF24 kox17 |RSG-A |Znf191 |ZSCAN3 |ZFP191 锌指蛋白24 两个杂交 Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg急性髓样白血病 60 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EGFR Smrte途径 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING UBIQUITINATION PROTEASOME DEGRADATION 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL DN 69 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRABARCZYK BCL11B TARGETS UP 81 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola Sezary综合征DN 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides DN 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTIN INTERACT WITH HDAC 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
myllykangas放大热点23 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小藻塔蒂靶向 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SUZ12 TARGETS 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES WITH H3K27ME3 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH PRC2 TARGETS 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标3向上 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB目标1 DN 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando Lyl1邻居 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG IMMORTALIZED BY HOXA9 AND MEIS1 DN 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成4 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制新皮层DN 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VARELA ZMPSTE24 TARGETS UP 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素耐药性DN处的sartipy正常 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌腔 84 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER POOR SURVIVAL UP 31 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN MCV6 HCP WITH H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hahtola CTCL皮肤 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pILON KLF1 TARGETS DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因