基因页：CA12

概括?
基因ID 771
Symbol CA12
同义词 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816
描述 碳赤铁酶XII
参考 MIM：603263|HGNC：HGNC：1371|HPRD:04464|
基因type protein-coding
地图位置 15Q22
Pascal P值 0.003
Sherlock P值 0.546
Fetal beta 1.426
DMG 1（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
Meta

数据源中的基因
基因本身t name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg04344695 15 63658391 CA12 5.462E-4 0.261 0.049 DMG:Wockner_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs10519209 chr15 63713499 CA12 771 0.08 cis
rs596985 chr1 64277034 CA12 771 0.09 trans
RS16838771 chr1 157511227 CA12 771 2.992E-5 trans
rs16855059 chr1 205053149 CA12 771 2.353E-4 trans
rs11240354 chr1 205057481 CA12 771 2.353E-4 trans
rs7537872 chr1 217028527 CA12 771 0.1 trans
rs10490376 chr2 41381375 CA12 771 0.03 trans
rs17028172 chr2 103608895 CA12 771 0.13 trans
RS4680999 chr3 78613401 CA12 771 0.01 trans
rs3025740 chr4 114163593 CA12 771 0.02 trans
rs6933331 chr6 29495279 CA12 771 0.02 trans
RS16892042 chr6 81347874 CA12 771 0.06 trans
rs9397728 chr6 150514248 CA12 771 0.01 trans
rs4033270 chr7 8998664 CA12 771 0.16 trans
RS1539067 chr10 124508735 CA12 771 0.1 trans
rs17153228 chr10 127279570 CA12 771 0.08 trans
RS11018189 chr10 129345787 CA12 771 0.05 trans
rs11178165 chr12 70669547 CA12 771 0.14 trans
rs11178166 chr12 70670585 CA12 771 0.04 trans
rs2297479 chr12 125591249 CA12 771 0.09 trans
RS10150355 chr14 23625981 CA12 771 0.05 trans
rs17104965 chr14 37145915 CA12 771 0.06 trans
rs8013004 chr14 41098282 CA12 771 0.13 trans
rs7171135 chr15 86479875 CA12 771 0.05 trans
rs708248 chr16 54130069 CA12 771 0.17 trans
rs2124228 chr18 11339758 CA12 771 0.12 trans
rs11080561 chr18 12257229 CA12 771 0.03 trans
rs8109860 chr19 4673513 CA12 771 0 trans
rs1883665 chrX 17650382 CA12 771 7.994E-4 trans
rs7062071 chrX 17724830 CA12 771 0.15 trans
rs16980281 chrX 143440371 CA12 771 0.17 trans
rs7879274 chrX 145592957 CA12 771 0.1 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
cacna1b 0.88 0.92
FRY 0.85 0.90
LARP1 0.85 0.89
HERC2 0.84 0.89
ANK2 0.84 0.89
AC092324.1 0.84 0.89
megf8 0.84 0.88
PRRG3 0.83 0.87
Shank2 0.83 0.88
MAGI2 0.83 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.63 -0.65
GNG11 -0.62 -0.72
higd1b -0.62 -0.67
AC021016.1 -0.62 -0.65
FXYD1 -0.61 -0.60
AF347015.21 -0.61 -0.68
SAT1 -0.61 -0.70
C1orf54 -0.61 -0.74
MT-CO2 -0.61 -0.63
VAMP5 -0.60 -0.68

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG NITROGEN METABOLISM 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
二氧化碳的反应可逆水合 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧 92 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL UP 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE BREAST CANCER ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAEGER METASTASIS DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN NPM1 MUTATED SIGNATURE 1 UP 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN NPM1 SIGNATURE 3 UP 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 2HR UP 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 12HR UP 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION DN 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OLSSON E2F3 TARGETS UP 28 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OXFORD RALA OR RALB TARGETS DN 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管DN 114 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAIRKEE TERT TARGETS UP 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYC AMPLIFICATION TARGETS UP 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BREAST CANCER ESR1 UP 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIAO METASTASIS 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS POORLY DN 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS UP 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRASOR RESPONSE TO ESTRADIOL UP 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM APC TARGETS UP 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STOSSI RESPONSE TO ESTRADIOL 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Traynor Rett综合征 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS HYPOXIA 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 24HR DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAMASWAMY METASTASIS DN 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 18HR DN 178 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG HYPOXIA NORMAL 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS UP 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD SRC ONCOGENIC SIGNATURE 62 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标RESPONSIVE TO ESTROGEN UP 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH RESPONSE TO ESTRADIOL 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MISHRA CARCINOMA ASSOCIATED FIBROBLAST UP 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脑DN中的乳腺癌复发 85 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE UP 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER LUMINAL B UP 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS UP 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG DASATINIB RESISTANCE DN 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUPER BREAST BASAL VS LUMINAL UP 54 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MALONEY RESPONSE TO 17AAG DN 79 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLOTHO PEDIATRIC ALL THERAPY RESPONSE DN 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAN SATB1 TARGETS DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESR1 TARGETS 85 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
国外RB1增长目标 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR UP 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AZARE NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY STAT3 UP 121 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RARG BOUND MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RAR TARGETS UP 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PECE MAMMARY STEM CELL DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因