基因页:ZNF165
概括?
基因 | 7718 |
象征 | ZNF165 |
同义词 | CT53 | LD65 | ZSCAN7 |
描述 | 锌指蛋白165 |
参考 | MIM:600834|HGNC:HGNC:12953|ENSEMBL:ENSG00000197279|HPRD:02903|Vega:Otthumg0000000014505 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 2.354e-12 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF165_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SYT4 | 0.78 | 0.84 |
Smarca1 | 0.77 | 0.80 |
Zwilch | 0.76 | 0.83 |
SLC35A1 | 0.75 | 0.79 |
LRRN3 | 0.75 | 0.83 |
HMGCR | 0.75 | 0.83 |
HMGCS1 | 0.74 | 0.84 |
aadat | 0.74 | 0.73 |
TTC13 | 0.74 | 0.78 |
Znf75d | 0.74 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.58 | -0.73 |
AF347015.33 | -0.58 | -0.70 |
AIFM3 | -0.58 | -0.64 |
AF347015.31 | -0.58 | -0.71 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.69 |
mt-cyb | -0.56 | -0.71 |
ZNF385A | -0.56 | -0.65 |
FXYD1 | -0.56 | -0.67 |
AF347015.8 | -0.56 | -0.72 |
HLA-F | -0.55 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | nas | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16189514 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | nas | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | nas | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CCDC130 | MGC10471 | 包含130 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 16189514 |
CCDC85B | dipa | 包含85b | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
DVL2 | - | Dish,DSH同源2(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 16189514 |
ewsr1 | ews | 尤因肉瘤断裂点区域1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 16189514 |
FAM124A | FLJ30707 | 具有序列相似性的家庭124a | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
KRTAP4-12 | kap4.12 |KRTAP4.12 | 角蛋白相关蛋白4-12 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
myst2 | HBO1 |HBOA |Kat7 | Myst组蛋白乙酰转移酶2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
PDLIM7 | LMP1 | PDZ和LIM域7(Enigma) | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
Scand1 | RAZ1 |SDP1 | 扫描域包含1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
TCEB3B | eloa2 |HST832 |MGC119351 |TCEB3L | 转录伸长因子B多肽3B(Erongin A2) | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
ZNF192 | LD5-1 |ZKSCAN8 | 锌指蛋白192 | 两个杂交 | Biogrid | 10567577 |
ZNF24 | kox17 |RSG-A |Znf191 |ZSCAN3 |ZFP191 | 锌指蛋白24 | 两个杂交 | Biogrid | 10567577 |
ZNF250 | FLJ57354 |MGC111123 |MGC9718 |ZFP647 |ZNF647 | 锌指蛋白250 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
ZNF446 | FLJ20626 |ZKSCAN20 |ZSCAN30 | 锌指蛋白446 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chathafe乳腺癌基础与间充质 | 121 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗 | 78 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |