基因页：Trim26
概括？
| 基因 | 7726 |
| 象征 | Trim26 |
| 同义词 | 法新社| RNF95 | ZNF173 |
| 描述 | 包含26的三方图案 |
| 参考 | MIM：600830|HGNC：HGNC：12962|ENSEMBL：ENSG00000234127|HPRD：02901|Vega：Otthumg00000031041 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 1E-12 |
| Sherlock P值 | 0.906 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7981812 | CHR13 | 55312710 | Trim26 | 7726 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF615 | 0.96 | 0.96 |
| ZFP112 | 0.95 | 0.95 |
| RBM39 | 0.95 | 0.96 |
| SNW1 | 0.94 | 0.93 |
| SMC3 | 0.94 | 0.94 |
| DDX46 | 0.94 | 0.94 |
| RNF20 | 0.94 | 0.94 |
| myef2 | 0.94 | 0.93 |
| METAP2 | 0.94 | 0.93 |
| SF3B1 | 0.94 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ifi27 | -0.72 | -0.87 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.84 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.83 |
| AF347015.27 | -0.71 | -0.82 |
| HLA-F | -0.70 | -0.77 |
| FXYD1 | -0.70 | -0.84 |
| AF347015.33 | -0.69 | -0.81 |
| pth1r | -0.68 | -0.76 |
| higd1b | -0.68 | -0.84 |
| AIFM3 | -0.67 | -0.75 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | 塔斯 | 8530076 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | 塔斯 | 8530076 | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| der ifn alpha响应 | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| der ifn beta响应 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| der ifn伽马响应 | 71 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C0的反应 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染6小时 | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 8小时 | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-1/206 | 1129 | 1135 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||