基因页:ZNF229
概括?
基因 | 7772 |
象征 | ZNF229 |
同义词 | - |
描述 | 锌指蛋白229 |
参考 | HGNC:HGNC:13022|ENSEMBL:ENSG00000278318|HPRD:18324|Vega:Otthumg00000182377 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.31 |
Pascal P值 | 0.082 |
胎儿β | 0.683 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ZNF229 | CHR19 | 44933974 | G | 一个 | NM_014518 | p.328r> w | 错过 | 精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF229_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MRPL45 | 0.95 | 0.93 |
EIF2A | 0.93 | 0.92 |
IGBP1 | 0.93 | 0.94 |
GTF2B | 0.93 | 0.91 |
CCT7 | 0.93 | 0.92 |
CCT4 | 0.92 | 0.90 |
PSMD14 | 0.92 | 0.88 |
CCT8 | 0.92 | 0.92 |
hnrnpc | 0.92 | 0.92 |
kars | 0.92 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.81 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.81 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.81 |
mt-cyb | -0.74 | -0.81 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.73 | -0.80 |
AF347015.2 | -0.73 | -0.82 |
AF347015.15 | -0.72 | -0.80 |
AF347015.26 | -0.70 | -0.80 |
AF347015.21 | -0.70 | -0.79 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向 | 112 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |