基因页:MAP3K12
概括?
基因 | 7786 |
象征 | MAP3K12 |
同义词 | DLK | MEKK12 | MUK | ZPK | ZPKP1 |
描述 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶12 |
参考 | MIM:600447|HGNC:HGNC:6851|ENSEMBL:ENSG00000139625|HPRD:02709|Vega:Otthumg00000169854 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q13 |
Pascal P值 | 0.014 |
Sherlock P值 | 0.443 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | MAP3K12 | 7786 | 0 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | MAP3K12 | 7786 | 0.01 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | MAP3K12 | 7786 | 0.07 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | MAP3K12 | 7786 | 0.08 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | MAP3K12 | 7786 | 1.478E-7 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAP3K12_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Junb | 0.83 | 0.63 |
FOXF1 | 0.80 | 0.73 |
apold1 | 0.77 | 0.72 |
ZFP36 | 0.76 | 0.78 |
DUSP1 | 0.75 | 0.62 |
fos | 0.73 | 0.67 |
fosb | 0.73 | 0.50 |
ICAM1 | 0.72 | 0.77 |
GADD45B | 0.72 | 0.61 |
NPAS4 | 0.72 | 0.23 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C12orf45 | -0.34 | -0.49 |
UCHL3 | -0.33 | -0.45 |
TCTEX1D2 | -0.33 | -0.48 |
FRG1 | -0.32 | -0.44 |
GTF2H5 | -0.32 | -0.41 |
PFDN2 | -0.32 | -0.44 |
Med19 | -0.32 | -0.45 |
PDCD5 | -0.32 | -0.47 |
STMN1 | -0.32 | -0.45 |
ZCCHC17 | -0.32 | -0.37 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta MAPK途径 | 87 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St JNK MAPK途径 | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID p38 alpha beta途径 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Finetti乳腺癌Kinome Blue | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌腔 | 84 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 | 152 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |