基因页：ZYX

概括?
基因ID 7791
Symbol ZYX
同义词 ESP-2 | HED-2
描述 zyxin
参考 MIM:602002|HGNC:HGNC:13200|ENSEMBL：ENSG00000159840|HPRD:03592|Vega:OTTHUMG00000023822
基因type protein-coding
地图位置 7q32
Pascal P值 0.06
Sherlock P值 0.528
Fetal beta -0.294
DMG 1（＃研究）
eGene 尾状基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 2
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.01

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
CG05102190 7 143078242 ZYX 3.84E-5 -0.23 0.02 DMG:Wockner_2014
cg02471194 7 143078198 ZYX 5.7E-5 -0.317 0.022 DMG:Wockner_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs17328164 chr19 34424089 ZYX 7791 0.11 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
WDR27 0.91 0.88
ANKRD10 0.91 0.88
FBN3 0.90 0.92
极 0.90 0.93
TRPV1 0.90 0.85
MYO19 0.89 0.79
CCNL2 0.89 0.84
RAD52 0.89 0.80
RBM5 0.89 0.89
GAL3ST4 0.89 0.85
前10个负共表达基因
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
HLA-F -0.57 -0.69
FBXO2 -0.57 -0.65
C5orf53 -0.56 -0.76
ACYP2 -0.56 -0.66
ALDOC -0.56 -0.64
S100B -0.55 -0.76
CA4 -0.55 -0.72
ACOT13 -0.55 -0.70
AIFM3 -0.55 -0.65
HLA-C -0.54 -0.68

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 10831611
GO:0008270 zinc ion binding IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007155 细胞粘附 塔斯 8940160
GO:0007267 cell-cell signaling 塔斯 8940160
去：0007165 signal transduction 塔斯 8940160
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0001725 stress fiber IDA 18297730
GO:0005856 cytoskeleton IEA -
GO:0005634 核 IEA -
GO:0005737 细胞质 IDA 18029348
GO:0005737 细胞质 IEA -
去：0005925 focal adhesion IDA 18029348|18297730
去：0005913 cell-cell adherens junction IDA 8940160
GO:0005886 质膜 塔斯 8940160
GO:0005887 质膜的积分 塔斯 8940160

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ACTN1 FLJ40884 actinin, alpha 1 - HPRD，Biogrid 10224105|11423549
BCAR1 CAS | CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas breast cancer anti-estrogen resistance 1 Affinity Capture-Western BioGRID 11782456
Bspry FLJ20150 B-box and SPRY domain containing - HPRD 10978534
ENAH Ena |梅纳|NDPP1 启用同源物（果蝇） - HPRD，Biogrid 10801818
LASP1 Lasp-1 | MLN50 LIM and SH3 protein 1 Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 15004028
LATS1 WARTS | wts LATS, large tumor suppressor, homolog 1 (Drosophila) Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 10831611
NEBL FLJ53769 | LNEBL | MGC119746 | MGC119747 | bA56H7.1 nebulette - HPRD，Biogrid 15004028
NEDD9 CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 - HPRD，Biogrid 11782456
RPH3AL NOC2 rabphilin 3A-like (without C2 domains) - HPRD 9367993
测试工程师 DKFZp586B2022 | MGC1146 | TESS | TESS-2 testis derived transcript (3 LIM domains) Reconstituted Complex BioGRID 12695497
VASP - vasodilator-stimulated phosphoprotein - HPRD 7644520|10801818
|10851246|10882740
VASP - vasodilator-stimulated phosphoprotein Affinity Capture-Western
in vitro
体内
两个杂交		 BioGRID 10801818|10882740
VAV1 VAV vav 1 guanine nucleotide exchange factor - HPRD 8622875
VAV3 FLJ40431 VAV 3鸟嘌呤核苷酸交换因子 - HPRD 8622875
ZHX1 - 锌的手指和同源蛋白酶1 两个杂交 BioGRID 12659632


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA INTEGRIN PATHWAY 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST INTEGRIN SIGNALING PATHWAY 82 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ILK PATHWAY 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ECADHERIN KERATINOCYTE PATHWAY 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ECADHERIN STABILIZATION PATHWAY 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID THROMBIN PAR1 PATHWAY 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION DN 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGASHIMA NRG1 SIGNALING UP 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS UP 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN UP 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUMMERICH SKIN CANCER PROGRESSION DN 100 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI THYROID CANCER CLUSTER 4 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牛甲基化的乳腺癌 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU LIVER CANCER 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移DN 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML复发预后 35 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOLUB ALL VS AML DN 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ASTIER INTEGRIN SIGNALING 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML SURVIVAL 129 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEIGEL OXIDATIVE STRESS BY TBH AND H2O2 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS UP 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
预告BRCA1焦油GETS DN 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制新皮层DN 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C3的响应 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE TARGETS OF TGFB1 AND WNT3A UP 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI PLASMACYTOMA UP 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG TIP30 TARGETS DN 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARK APL PATHOGENESIS DN 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼（Hoffmann 75 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KARLSSON TGFB1 TARGETS UP 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS LOW SERUM 100 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga PML Interactome 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS UP 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-103/107 280 286 1A HSA-MIR-103脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-15/16/195/424/497 268 274 m8 hsa-miR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
hsa-miR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU