基因页：DDR1

概括？
基因 780
象征 DDR1
同义词 cak | cd167 | ddr | eddr1 | hgk2 | mck10 | nep | ntrk4 | ptk3 | ptk3a | rtk6 | trke
描述 盘状蛋白结构域受体酪氨酸激酶1
参考 MIM：600408|HGNC：HGNC：2730|ENSEMBL：ENSG00000204580|HPRD：02678|Vega：Otthumg0000000031236
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1.847E-13
Sherlock P值 0.166
胎儿β 0.826
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 4
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 1 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.033
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：2.35
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0973

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16111190 6 30860887 DDR1 3.78e-5 0.011 0.084 DMG：Montano_2016
CG19148201 6 30860237 DDR1 5.09e-5 0.011 0.098 DMG：Montano_2016
CG17879299 6 30860300 DDR1 9.97e-5 0.015 0.12 DMG：Montano_2016
CG07979747 6 30860136 DDR1 2.31E-4 0.007 0.164 DMG：Montano_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6879593 CHR5 75253310 DDR1 780 0.19 反式
RS10126993 Chrx 35885796 DDR1 780 0.08 反式
RS4501739 Chrx 35960848 DDR1 780 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AGAP3 0.90 0.89
GSK3A 0.89 0.89
TBC1D25 0.89 0.89
STK25 0.88 0.86
numbl 0.88 0.89
FAM160A2 0.88 0.88
DTX3 0.87 0.87
EPN1 0.87 0.86
Zmiz2 0.87 0.90
brsk2 0.86 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.78 -0.72
AF347015.8 -0.76 -0.72
AF347015.31 -0.76 -0.71
AF347015.21 -0.76 -0.76
mt-cyb -0.75 -0.70
AF347015.33 -0.75 -0.70
AF347015.26 -0.75 -0.69
AF347015.27 -0.74 -0.73
AF347015.15 -0.72 -0.69
AL139819.3 -0.72 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004714 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性 塔斯 神经突（GO期限：8） 9659899
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004872 受体活性 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 17721511
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0004713 蛋白酪氨酸激酶活性 IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007169 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 IEA -
去：0007155 细胞粘附 塔斯 8302582
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 8390675

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Col11a1 co11a1 |coll6 |STL2 胶原蛋白，XI型，Alpha 1 - HPRD 9659900
COL2A1 anfh |AOM |col11a3 |MGC131516 |SEDC 胶原蛋白，II型，Alpha 1 - HPRD 9659900
COL3A1 EDS4A |FLJ34534 胶原蛋白，III型，Alpha 1 - HPRD 9659900
COL5A2 MGC105115 胶原蛋白，V型，Alpha 2 - HPRD 9659900
DDR1 cak |CD167 |DDR |EDDR1 |MCK10 |NEP |ntrk4 |ptk3 |ptk3a |RTK6 | TRKE 盘状蛋白结构域受体酪氨酸激酶1 DDR1受体酪氨酸激酶自体磷酸化 绑定 9659899
FRS2 FRS2A |frs2alpha |SNT |SNT-1 |SNT1 成纤维细胞生长因子受体底物2 - HPRD 10783152
PLCG1 PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 磷脂酶C，伽马1 - HPRD 10783152
RGS2 G0S8 G蛋白信号的调节剂2，24KDA 两个杂交 Biogrid 16169070
SHC1 FLJ26504 |SHC |SHCA SHC（SRC同源性2结构域）转化蛋白1 - HPRD 10783152
SHC1 FLJ26504 |SHC |SHCA SHC（SRC同源性2结构域）转化蛋白1 DDR1与SHC相互作用。 绑定 9659899|10681566
Snapin 快照 快速相关的蛋白质 两个杂交 Biogrid 16169070
SNRNP40 40k |FLJ41108 |HPRP8BP |MGC1910 |prp8bp |prpf8bp |RP11-490K7.3 |SPF38 |WDR57 小核核糖核蛋白40KDA（U5） 两个杂交 Biogrid 16169070
TM4SF1 H-L6 |L6 |M3S1 |taal6 跨膜4 L六个家庭成员1 两个杂交 Biogrid 16169070
ttr HST2651 |palb |TBPA 经硫代蛋白 两个杂交 Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bogni治疗与髓样白血病DN有关 33 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合的TONKS目标维持在红细胞中 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton Akt1通过mtor向上信号传导 34 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG UP 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
帕特森多西他赛电阻 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borlak肝癌EGF UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI对肿瘤转移的耐药性 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 70 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF信号DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤Igll vs Iglk 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 92 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo卡路里限制肌肉DN 87 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU遗传毒性损伤24小时 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C5的反应 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Della对TSA和丁酸酯的反应 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia延迟对TGFB1的响应 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee转移和替代剪接 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN 60 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vilimas Notch1靶向 52 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
突变率丁肺癌 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
woo肝癌复发 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamanaka胶质母细胞瘤生存DN 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 128 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 142 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC LCP带有H3K4ME3 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上 146 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-199 416 423 1A，M8 HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc