基因页面:LAPTM5
总结吗?
| GeneID | 7805年 |
| 象征 | LAPTM5 |
| 同义词 | CLAST6 |
| 描述 | 溶酶体蛋白跨膜5 |
| 参考 | MIM: 601476|HGNC: HGNC: 29612|运用:ENSG00000162511|HPRD: 03280|织女:OTTHUMG00000003707 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1的意思是 |
| 帕斯卡假定值 | 0.023 |
| 夏洛克假定值 | 0.03 |
| 胎儿β | -1.861 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LAPTM5 | chr1 | 31212671 | G | T | NM_006762 | 。 | 沉默 | 精神分裂症 | 认为:Gulsuner_2013 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16859655 | chr3 | 147395722 | LAPTM5 | 7805年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs3804100 | chr4 | 154625408 | LAPTM5 | 7805年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs17319860 | chr4 | 160647108 | LAPTM5 | 7805年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs10116858 | chr9 | 20300988 | LAPTM5 | 7805年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs17111364 | chr10 | 97901813 | LAPTM5 | 7805年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs7119964 | chr11 | 10425509 | LAPTM5 | 7805年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs11216730 | chr11 | 117918701 | LAPTM5 | 7805年 | 0.09 | 反式 | ||
| snp_a - 2081410 | 0 | LAPTM5 | 7805年 | 0.13 | 反式 | |||
| rs16982879 | chrX | 92924110 | LAPTM5 | 7805年 | 0.06 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| STAT6 | 0.69 | 0.71 |
| COBL | 0.69 | 0.65 |
| GPR3 | 0.67 | 0.62 |
| SIRPA | 0.67 | 0.69 |
| EHD2 | 0.66 | 0.72 |
| VIPR1 | 0.66 | 0.62 |
| BHLHE40 | 0.66 | 0.68 |
| MAST3 | 0.66 | 0.58 |
| SMAD3 | 0.66 | 0.64 |
| TMEM184B | 0.66 | 0.63 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPL34 | -0.47 | -0.63 |
| RPL23A | -0.47 | -0.55 |
| TUBB2B | -0.47 | -0.50 |
| 项目实施 | -0.47 | -0.50 |
| RPS8 | -0.46 | -0.58 |
| RPS19P3 | -0.46 | -0.60 |
| RPL5 | -0.46 | -0.55 |
| PPP1R14B | -0.46 | -0.58 |
| AC008073.1 | -0.46 | -0.53 |
| TIGD1 | -0.46 | -0.44 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG溶酶体 | 121年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHUETZ乳腺癌导管侵入性 | 351年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 图姆收缩期心力衰竭 | 423年 | 283年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 如多发性骨髓瘤DN | 62年 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名1 | 380年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 | 418年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合HSC DN | 187年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SENESE HDAC1和HDAC2目标 | 238年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王食道癌和正常 | 121年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 邓恩的目标AML1 MTG8融合起来 | 52 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 穆勒甲基化在胶质母细胞瘤 | 40 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RASHI电离辐射反应6 | 84年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群2 b | 392年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HEIDENBLAD扩增子8抓起DN | 46 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRUETZMANN胰腺癌起来 | 358年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KHETCHOUMIAN TRIM24目标了 | 47 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MORI浆细胞DN | 33 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不知道背景目标1 | 140年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 低音部B淋巴细胞网络 | 143年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 彭亮氨酸剥夺了 | 142年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植排斥和好的 | 87年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维兰德被乙肝病毒感染 | 101年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IIZUKA肝癌早期复发 | 11 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NING慢性阻塞性肺疾病 | 157年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 彭雷帕霉素的反应了 | 203年 | 130年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗斯AML AML1 ETO融合 | 76年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 纳德勒肥胖了 | 61年 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 公园HSC标记 | 44 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FERRANDO T与MLL ENL融合起来 | 87年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王MLL CBP的目标融合起来 | 44 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YU MYC DN的目标 | 55 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 哈达德B淋巴细胞祖 | 293年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊格莱西亚斯E2F目标了 | 151年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 低音部CD40信号了 | 101年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 山崎TCEB3 DN的目标 | 215年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佐藤在胰腺癌1被甲基化 | 419年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 克劳克兰蛀牙了 | 253年 | 147年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STEARMAN肿瘤场效应 | 36 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STEARMAN肺癌早期和晚期DN | 61年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒通过甲基化沉默DN | 105年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC DN的目标 | 292年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标被甲基化DN | 281年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伽马辐射后AMUNDSON穷人生存8 g | 95年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞DN | 216年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村转移 | 47 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村转移模型 | 45 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BHATI G2M逮捕2 methoxyestradiol DN | 127年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRISHNAN FURIN目标了 | 12 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 贝尔神经胶质瘤干细胞DN | 66年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ICHIBA移植物抗宿主病35 d | 131年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 纳特GBM VS AO神经胶质瘤 | 46 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特 | 491年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李区分T淋巴细胞 | 200年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| POOLA浸润性乳腺癌 | 288年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYAULT肝癌子类G5 DN | 27 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和T 8 21易位 | 368年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 H3K4ME3连结控制协定 | 162年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森IPS H3K4ME3连结控制协定 | 174年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOSHIDA肝癌子类S1 | 237年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒30分钟DN | 150年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTENS受PML RARA融合 | 456年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK胶质母细胞瘤间质 | 216年 | 130年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 国外RB1目标衰老 | 572年 | 352年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DEMAGALHAES老化了 | 55 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 肿瘤抑制SMAD1和穿SMAD5 | 134年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHYLA CBFA2T3目标了 | 387年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PASINI SUZ12目标了 | 112年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KATSANOU ELAVL1目标了 | 169年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SERVITJA胰岛HNF1A目标 | 163年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |