基因页：NPHS2
概括？
| 基因 | 7827 |
| 象征 | NPHS2 |
| 同义词 | PDCN | SRN1 |
| 描述 | NPHS2 podocin |
| 参考 | MIM：604766|HGNC：HGNC：13394|ENSEMBL：ENSG00000116218|HPRD：05303|Vega：Otthumg0000000035252 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q25.2 |
| 胎儿β | -0.624 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23045073 | 1 | 179545458 | NPHS2 | -0.021 | 0.71 | DMG：Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DNAJB11 | 0.86 | 0.87 |
| SRP14 | 0.81 | 0.81 |
| SUGT1 | 0.80 | 0.80 |
| AC106037.2 | 0.80 | 0.83 |
| NME7 | 0.80 | 0.81 |
| MRPL9 | 0.80 | 0.80 |
| thoc4 | 0.79 | 0.82 |
| SFRS9 | 0.79 | 0.84 |
| PSMA4 | 0.79 | 0.79 |
| CXORF26 | 0.79 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.33 | -0.60 | -0.67 |
| AF347015.2 | -0.58 | -0.69 |
| AF347015.27 | -0.58 | -0.65 |
| AF347015.8 | -0.57 | -0.64 |
| AF347015.15 | -0.57 | -0.66 |
| tinagl1 | -0.57 | -0.64 |
| AF347015.31 | -0.57 | -0.64 |
| MT-CO2 | -0.56 | -0.63 |
| HLA-F | -0.56 | -0.61 |
| AF347015.9 | -0.55 | -0.67 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID肾素Neph1途径 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21靶向DN | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1自分泌目标DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |