基因页：CACNB2

概括？
基因 783
象征 CACNB2
同义词 cacnlb2 | cavb2 | mysb
描述 钙电压门控通道辅助亚基β2
参考 MIM：600003|HGNC：HGNC：1402|Ensembl：ENSG00000165995|HPRD：02473|Vega：Otthumg0000000017764
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p12
Pascal P值 1.42E-9
Sherlock P值 0.13
胎儿β -2.671
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历：RIPKE_2013 全基因组协会研究 多阶段GWA，瑞典人口和PGC2。24个领先的SNP
LK：是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS7893279 Chr10 18745105 TG 3.562e-11 内含子 CACNB2

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6481737 Chr10 19360952 CACNB2 783 0.13 顺式
RS4509661 Chr10 19362931 CACNB2 783 0.18 顺式
RS4465279 Chr10 19363075 CACNB2 783 0.16 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
去：0005245 电压门控钙通道活性 IEA -
去：0005245 电压门控钙通道活性 塔斯 9254841
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007528 神经肌肉连接开发 塔斯 突触（GO期限：10） 8494331
去：0006816 钙离子传输 IEA -
去：0006816 钙离子传输 nas -
去：0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005886 质膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 nas 9594024
去：0005891 电压门控钙通道复合物 塔斯 9254841

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg心肌收缩 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG心律失常右心肌病ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
能量代谢的反应组整合 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM1相互作用 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM信号传导，用于神经突的生长 64 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组抑制肾上腺素去肾上腺素的胰岛素分泌 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen LVAD支持失败的心脏DN 42 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制新皮层DN 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌，H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 540 546 M8 HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-124.1 490 496 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 490 496 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 1265 1271 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-145 1279 1285 1a HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-151 729 735 1a HSA-MIR-151脑 Acuagacugaagcucuugagg
mir-181 814 820 M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-182 1187 1193 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-199 958 964 1a HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
mir-208 647 653 1a HSA-MIR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-26 1555年 1561年 1a HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-27 1265 1271 M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-5p 1329 1336 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-31 487 493 M8 HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
mir-339 684 690 1a HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-376c 529 536 1A，M8 HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-378 707 713 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-410 599 605 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-452 579 586 1A，M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-499 646 653 1A，M8 HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa
mir-543 568 574 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-9 1510 1516年 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-96 1187 1193 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc