Gene Page:FZD5

概括?
GeneID 7855
Symbol FZD5
同义词 C2orf31|HFZ5
描述 frizzled class receptor 5
参考 MIM:601723|HGNC:HGNC:4043|Ensembl:ENSG00000163251|HPRD:03427|Vega：Otthumg00000154790
Gene type protein-coding
Map location 2q33.3
Pascal p-value 0.083
Fetal beta -1.168
DMG 1（＃研究）
eGene Cerebellar Hemisphere
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 2
GSMA_IIA Genome scan meta-analysis (All samples) Psr: 0.00916
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） Psr: 0.01016

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg01201797 2 208635605 FZD5 1.928E-4 0.416 0.035 DMG:Wockner_2014
CG05365735 2 208635637 FZD5 3.122E-4 0.449 0.04 DMG:Wockner_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs10994209 chr10 61877705 FZD5 7855 0.05 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004872 receptor activity 塔斯 9054360
GO:0004930 G蛋白偶联受体活性 IEA -
GO:0005515 protein binding IEA -
去：0004926 non-G-protein coupled 7TM receptor activity IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007186 G-protein coupled receptor protein signaling pathway IEA -
GO:0016055 Wnt receptor signaling pathway IEA -
GO:0007164 建立组织极性 塔斯 8626800
GO:0048469 cell maturation IEA -
GO:0007275 多细胞生物发育 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0000139 高尔基膜 IEA -
GO:0005794 Golgi apparatus IEA -
GO:0005886 plasma membrane IEA -
GO:0005887 质膜的积分 塔斯 9054360

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG WNT SIGNALING PATHWAY 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG基底细胞癌 55 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WNT SIGNALING 89 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID WNT NONCANONICAL PATHWAY 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID BETA CATENIN DEG PATHWAY 18 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID WNT SIGNALING PATHWAY 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID WNT CANONICAL PATHWAY 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome B类2 Secralin家族受体 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPCR LIGAND BINDING 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE NEURAL CREST STEM CELL DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER GRADES 1 2 UP 137 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL DN 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
korkola蛋黄囊肿瘤 62 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 14HR UP 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUNINGER IGF1 VS PDGFB TARGETS UP 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制新皮层DN 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 24HR UP 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM APC MYC TARGETS 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GU PDEF TARGETS DN 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 UP 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH T 8 21 TRANSLOCATION 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR UP 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS UP 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-124.1 2998 3004 m8 hsa-miR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 2997 3004 1A,m8 hsa-miR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa-miR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-140 1150 1157 1A,m8 hsa - mir - 140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-149 1268 1274 1A hsa-miR-149脑 UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC
mir-155 4355 4361 1A hsa-miR-155 UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGG
mir-191 77 83 m8 hsa-miR-191脑 CAACGGAAUCCCAAAAGCAGCU
mir-194 3738 3744 1A hsa-miR-194 UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA
miR-219 4015 4022 1A,m8 HSA-MIR-219脑 ugauuguccaaacgcaauucu
miR-224 3820 3826 m8 HSA-MIR-224 CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA
miR-23 426 433 1A,m8 hsa-miR-23a脑 aucacauugccagggauucc
hsa-miR-23b脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-24 3859 3866 1A,m8 HSA-MIR-24SZ UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG
miR-323 426 432 1A HSA-MIR-323脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
miR-326 3276 3282 m8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
miR-330 3387 3393 1A HSA-MIR-330脑 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
miR-342 3455 3461 m8 HSA-MIR-342脑 UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUC
miR-369-3p 4226 4233 1A,m8 hsa-miR-369-3p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir-374 4227 4233 m8 hsa-miR-374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
mir-375 1209 1215 1A hsa-miR-375 UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA
miR-378* 3514 3521 1A,m8 HSA-MIR-422B CUGGACUUGGAGUCAGAAGGCC
HSA-MIR-422A cuggacuagggucagaaggcc
mir-381 3296 3302 1A hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-384 3283 3290 1A,m8 hsa-miR-384 AUUCCUAGAAAUUGUUCAUA
miR-421 3868 3875 1A,m8 HSA-MIR-421 GGCCUCAUUAAAUGUUUGUUG
miR-455 3872 3879 1A,m8 HSA-MIR-455 UAUGUGCCUUUGGACUACAUCG
mir-99/100 3831 3837 m8 HSA-MIR-99A脑 AACCCGUAGAUCCGAUCUUGUG
HSA-MIR-100脑 AACCCGUAGAUCCGAACUUGUG
HSA-MIR-99B脑 cacccguagaaccgaccuugcg