概括
基因 7867
象征 MAPKAPK3
同义词 3pk | mapkap-k3 | mapkap3 | mapkapk-3 | Mk-3
描述 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶3
参考 MIM:602130|HGNC:HGNC:6888|ENSEMBL:ENSG00000114738|HPRD:03678|Vega:Otthumg00000156850
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.3
Pascal P值 0.759
Sherlock P值 0.57
胎儿β -0.567
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01942884 3 50654499 MAPKAPK3 1.78E-8 -0.009 6.41E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1814869 CHR3 120614420 MAPKAPK3 7867 0.06 反式
RS9358517 CHR6 22224220 MAPKAPK3 7867 0.16 反式
RS17182597 CHR7 12393594 MAPKAPK3 7867 0 反式
RS10126993 Chrx 35885796 MAPKAPK3 7867 9.498E-4 反式
RS5973533 Chrx 35908945 MAPKAPK3 7867 0.17 反式
RS6629018 Chrx 35932709 MAPKAPK3 7867 0.02 反式
RS6527524 0 MAPKAPK3 7867 0.08 反式
RS4501739 Chrx 35960848 MAPKAPK3 7867 5.045e-5 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
USP1 0.96 0.96
PRPF40A 0.93 0.96
SMC3 0.93 0.95
Cenph 0.93 0.86
lin9 0.92 0.88
CCDC99 0.92 0.93
CTPS2 0.91 0.91
taf1a 0.91 0.91
SUV39H2 0.91 0.89
XPO1 0.91 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.62 -0.80
AF347015.31 -0.60 -0.87
AIFM3 -0.59 -0.76
MT-CO2 -0.59 -0.88
AF347015.27 -0.59 -0.84
pth1r -0.59 -0.76
FXYD1 -0.59 -0.86
AF347015.33 -0.59 -0.84
ifi27 -0.58 -0.86
FBXO2 -0.58 -0.68

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg vegf信号通路 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MAPK途径 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta HSP27途径 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P38 MK2途径 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta下游途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome对RAS的信号传导 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
向ERK的Reactome信号传导 36 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P38MAPK事件 13 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TLR级联反应组MAP激酶激活 50 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TA​​K1介导P38 MAPK激活 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heidenblad Amplicon 8Q24 UP 40 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 87 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova Prox1靶向DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM胃癌化学敏感性 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标刺激DN 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bernard PPAPDC1B目标DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因