基因页:MAPKAPK3
概括?
基因 | 7867 |
象征 | MAPKAPK3 |
同义词 | 3pk | mapkap-k3 | mapkap3 | mapkapk-3 | Mk-3 |
描述 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶3 |
参考 | MIM:602130|HGNC:HGNC:6888|ENSEMBL:ENSG00000114738|HPRD:03678|Vega:Otthumg00000156850 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.3 |
Pascal P值 | 0.759 |
Sherlock P值 | 0.57 |
胎儿β | -0.567 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01942884 | 3 | 50654499 | MAPKAPK3 | 1.78E-8 | -0.009 | 6.41E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1814869 | CHR3 | 120614420 | MAPKAPK3 | 7867 | 0.06 | 反式 | ||
RS9358517 | CHR6 | 22224220 | MAPKAPK3 | 7867 | 0.16 | 反式 | ||
RS17182597 | CHR7 | 12393594 | MAPKAPK3 | 7867 | 0 | 反式 | ||
RS10126993 | Chrx | 35885796 | MAPKAPK3 | 7867 | 9.498E-4 | 反式 | ||
RS5973533 | Chrx | 35908945 | MAPKAPK3 | 7867 | 0.17 | 反式 | ||
RS6629018 | Chrx | 35932709 | MAPKAPK3 | 7867 | 0.02 | 反式 | ||
RS6527524 | 0 | MAPKAPK3 | 7867 | 0.08 | 反式 | |||
RS4501739 | Chrx | 35960848 | MAPKAPK3 | 7867 | 5.045e-5 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAPKAPK3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
USP1 | 0.96 | 0.96 |
PRPF40A | 0.93 | 0.96 |
SMC3 | 0.93 | 0.95 |
Cenph | 0.93 | 0.86 |
lin9 | 0.92 | 0.88 |
CCDC99 | 0.92 | 0.93 |
CTPS2 | 0.91 | 0.91 |
taf1a | 0.91 | 0.91 |
SUV39H2 | 0.91 | 0.89 |
XPO1 | 0.91 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.62 | -0.80 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.87 |
AIFM3 | -0.59 | -0.76 |
MT-CO2 | -0.59 | -0.88 |
AF347015.27 | -0.59 | -0.84 |
pth1r | -0.59 | -0.76 |
FXYD1 | -0.59 | -0.86 |
AF347015.33 | -0.59 | -0.84 |
ifi27 | -0.58 | -0.86 |
FBXO2 | -0.58 | -0.68 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg vegf信号通路 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta MAPK途径 | 87 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta HSP27途径 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P38 MK2途径 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID p38 alpha beta下游途径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 | 74 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome对RAS的信号传导 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
向ERK的Reactome信号传导 | 36 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P38MAPK事件 | 13 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TLR级联反应组MAP激酶激活 | 50 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TAK1介导P38 MAPK激活 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 8Q24 UP | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 | 87 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤 | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova Prox1靶向DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血中间祖先 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARSON FOXP3目标刺激DN | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bernard PPAPDC1B目标DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |