概括
基因 7871
象征 SLMAP
同义词 拍击
描述 肌膜相关的蛋白质
参考 MIM:602701|HGNC:HGNC:16643|ENSEMBL:ENSG00000163681|HPRD:04079|Vega:Otthumg00000133764
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.2-P14.3
Pascal P值 0.314
胎儿β 0.581
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMANNRC

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14861221 3 57743016 SLMAP 3.863E-4 0.446 0.043 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS695809 CHR22 26278127 SLMAP 7871 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C7orf26 0.96 0.95
DBN1 0.95 0.96
ZNF48 0.95 0.95
RBM15B 0.95 0.95
DCAF15 0.95 0.94
MTA2 0.95 0.92
Trim28 0.95 0.97
CSNK1E 0.95 0.94
AKT1 0.95 0.94
EIF4A1 0.95 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.77 -0.91
AF347015.31 -0.76 -0.90
MT-CO2 -0.76 -0.92
AF347015.33 -0.76 -0.91
C5orf53 -0.76 -0.79
HLA-F -0.75 -0.80
S100B -0.74 -0.87
mt-cyb -0.74 -0.89
AF347015.8 -0.74 -0.91
FXYD1 -0.73 -0.87

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射5的响应5 147 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因