基因页:SLMAP
概括?
基因 | 7871 |
象征 | SLMAP |
同义词 | 拍击 |
描述 | 肌膜相关的蛋白质 |
参考 | MIM:602701|HGNC:HGNC:16643|ENSEMBL:ENSG00000163681|HPRD:04079|Vega:Otthumg00000133764 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.2-P14.3 |
Pascal P值 | 0.314 |
胎儿β | 0.581 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | G2CDB.HUMANNRC |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14861221 | 3 | 57743016 | SLMAP | 3.863E-4 | 0.446 | 0.043 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS695809 | CHR22 | 26278127 | SLMAP | 7871 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLMAP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C7orf26 | 0.96 | 0.95 |
DBN1 | 0.95 | 0.96 |
ZNF48 | 0.95 | 0.95 |
RBM15B | 0.95 | 0.95 |
DCAF15 | 0.95 | 0.94 |
MTA2 | 0.95 | 0.92 |
Trim28 | 0.95 | 0.97 |
CSNK1E | 0.95 | 0.94 |
AKT1 | 0.95 | 0.94 |
EIF4A1 | 0.95 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.91 |
AF347015.31 | -0.76 | -0.90 |
MT-CO2 | -0.76 | -0.92 |
AF347015.33 | -0.76 | -0.91 |
C5orf53 | -0.76 | -0.79 |
HLA-F | -0.75 | -0.80 |
S100B | -0.74 | -0.87 |
mt-cyb | -0.74 | -0.89 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.91 |
FXYD1 | -0.73 | -0.87 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |