基因页面:MANF
总结吗?
GeneID | 7873年 |
象征 | MANF |
同义词 | 头盔| ARP |
描述 | 中脑的星形胶质细胞衍生神经营养因子 |
参考 | MIM: 601916|HGNC: HGNC: 15461|运用:ENSG00000145050|HPRD: 03558|织女:OTTHUMG00000156897 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 p21.1 |
帕斯卡假定值 | 0.123 |
夏洛克假定值 | 0.478 |
胎儿β | 0.516 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg21034633 | 3 | 51423030 | MANF | 3.83 e-8 | -0.01 | 1.09 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs2039546 | chr10 | 130708164 | MANF | 7873年 | 0.04 | 反式 | ||
rs10829517 | chr10 | 130708957 | MANF | 7873年 | 0.05 | 反式 | ||
rs1563037 | chr10 | 130717934 | MANF | 7873年 | 0.08 | 反式 | ||
rs4751027 | chr10 | 130721516 | MANF | 7873年 | 0.13 | 反式 | ||
rs3899870 | chr13 | 97205717 | MANF | 7873年 | 0.02 | 反式 | ||
rs6102879 | chr20 | 41138766 | MANF | 7873年 | 0.15 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MANF_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SMARCB1 | 0.96 | 0.96 |
SSRP1 | 0.96 | 0.93 |
NVL | 0.96 | 0.91 |
ZNF3 | 0.95 | 0.90 |
U2AF1 | 0.95 | 0.92 |
ZSCAN21 | 0.95 | 0.91 |
IMPDH2 | 0.95 | 0.93 |
TRA2A | 0.95 | 0.94 |
TH1L | 0.95 | 0.90 |
SAAL1 | 0.95 | 0.88 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.88 |
HLA-F | -0.75 | -0.76 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.86 |
MT-CO2 | -0.74 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.74 | -0.86 |
C5orf53 | -0.74 | -0.74 |
AIFM3 | -0.73 | -0.76 |
MT-CYB | -0.72 | -0.86 |
AF347015.8 | -0.71 | -0.85 |
PTH1R | -0.70 | -0.71 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
渡边直肠癌放疗反应 | 108年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
加里CD5 DN的目标 | 431年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌24小时DN | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1 DN的目标 | 459年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标8小时DN | 129年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标12小时DN | 209年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮 | 293年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
前列腺癌·汤姆林了 | 40 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
梁造血干细胞数量大与小 | 44 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展48小时 | 487年 | 286年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX4 DN | 32 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GC PASQUALUCCI淋巴瘤的阶段 | 283年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MORI浆细胞了 | 51 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
挞挞浆细胞和B淋巴细胞 | 78年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德粉碎和燃烧突变 | 197年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗斯AML PML RARA融合 | 77年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
建筑师中央时钟 | 88年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NING慢性阻塞性肺病DN | 121年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭亮氨酸剥夺DN | 187年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭雷帕霉素反应DN | 245年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
高雄应对UVB辐射 | 86年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗兹癌症元签名 | 64年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KAAB心脏心房和心室 | 249年 | 170年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
朱巨细胞病毒了 | 120年 | 89年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
朱巨细胞病毒24小时 | 93年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王响应和XPC顺铂 | 202年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN WELCSH BRCA1目标 | 141年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标了 | 388年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RIZKI肿瘤侵袭性的3 d DN | 270年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN | 354年 | 216年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的肺癌喀斯特 | 491年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的喀斯特致癌签名 | 89年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHEDDEN肺癌生存A12好 | 317年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌子类未经DN | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML和T 8 21易位 | 368年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
弗尔涅腺泡的发育晚2 | 277年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
么时间响应黄体酮集群11 | 103年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |