总结吗?
GeneID 7873年
象征 MANF
同义词 头盔| ARP
描述 中脑的星形胶质细胞衍生神经营养因子
参考 MIM: 601916|HGNC: HGNC: 15461|运用:ENSG00000145050|HPRD: 03558|织女:OTTHUMG00000156897
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3 p21.1
帕斯卡假定值 0.123
夏洛克假定值 0.478
胎儿β 0.516
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg21034633 3 51423030 MANF 3.83 e-8 -0.01 1.09 e-5 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs2039546 chr10 130708164 MANF 7873年 0.04 反式
rs10829517 chr10 130708957 MANF 7873年 0.05 反式
rs1563037 chr10 130717934 MANF 7873年 0.08 反式
rs4751027 chr10 130721516 MANF 7873年 0.13 反式
rs3899870 chr13 97205717 MANF 7873年 0.02 反式
rs6102879 chr20 41138766 MANF 7873年 0.15 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMARCB1 0.96 0.96
SSRP1 0.96 0.93
NVL 0.96 0.91
ZNF3 0.95 0.90
U2AF1 0.95 0.92
ZSCAN21 0.95 0.91
IMPDH2 0.95 0.93
TRA2A 0.95 0.94
TH1L 0.95 0.90
SAAL1 0.95 0.88
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.75 -0.88
HLA-F -0.75 -0.76
AF347015.31 -0.74 -0.86
MT-CO2 -0.74 -0.87
AF347015.33 -0.74 -0.86
C5orf53 -0.74 -0.74
AIFM3 -0.73 -0.76
MT-CYB -0.72 -0.86
AF347015.8 -0.71 -0.85
PTH1R -0.70 -0.71

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
渡边直肠癌放疗反应 108年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
加里CD5 DN的目标 431年 263年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌24小时DN 214年 133年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1 DN的目标 459年 276年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标8小时DN 129年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标12小时DN 209年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应表皮 293年 179年 所有SZGR 2.0基因通路
前列腺癌·汤姆林了 40 27 所有SZGR 2.0基因通路
梁造血干细胞数量大与小 44 24 所有SZGR 2.0基因通路
魏MYCN目标与E箱 795年 478年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN 514年 330年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展48小时 487年 286年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX4 DN 32 22 所有SZGR 2.0基因通路
GC PASQUALUCCI淋巴瘤的阶段 283年 177年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH MYC最大目标 775年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
乔治MIR192和MIR215的目标 893年 528年 所有SZGR 2.0基因通路
MORI浆细胞了 51 29日 所有SZGR 2.0基因通路
挞挞浆细胞和B淋巴细胞 78年 51 所有SZGR 2.0基因通路
谢泼德粉碎和燃烧突变 197年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
罗斯AML PML RARA融合 77年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
建筑师中央时钟 88年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
NING慢性阻塞性肺病DN 121年 79年 所有SZGR 2.0基因通路
彭亮氨酸剥夺DN 187年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
彭雷帕霉素反应DN 245年 154年 所有SZGR 2.0基因通路
彭谷氨酰胺剥夺DN 337年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃早期造血祖 532年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
高雄应对UVB辐射 86年 55 所有SZGR 2.0基因通路
罗兹癌症元签名 64年 47 所有SZGR 2.0基因通路
KAAB心脏心房和心室 249年 170年 所有SZGR 2.0基因通路
朱巨细胞病毒了 120年 89年 所有SZGR 2.0基因通路
朱巨细胞病毒24小时 93年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
王响应和XPC顺铂 202年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
DN WELCSH BRCA1目标 141年 92年 所有SZGR 2.0基因通路
斯坦ESRRA目标了 388年 234年 所有SZGR 2.0基因通路
RIZKI肿瘤侵袭性的3 d DN 270年 181年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN 354年 216年 所有SZGR 2.0基因通路
研究包括 420年 269年 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的肺癌喀斯特 491年 316年 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的喀斯特致癌签名 89年 56 所有SZGR 2.0基因通路
SHEDDEN肺癌生存A12好 317年 177年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋触性DN 668年 419年 所有SZGR 2.0基因通路
蒋介石肝癌子类未经DN 193年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和T 8 21易位 368年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
斯坦ESRRA目标 535年 325年 所有SZGR 2.0基因通路
弗尔涅腺泡的发育晚2 277年 172年 所有SZGR 2.0基因通路
党受MYC 1103年 714年 所有SZGR 2.0基因通路
么时间响应黄体酮集群11 103年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
李BMP2 DN的目标 882年 538年 所有SZGR 2.0基因通路
不是通过P38冯氏TNF响应 337年 236年 所有SZGR 2.0基因通路