概括
基因 7879
象征 Rab7a
同义词 Pro2706 | Rab7
描述 Rab7a,Ras Oncogene家族成员
参考 MIM:602298|HGNC:HGNC:9788|Ensembl:ENSG0000000075785|HPRD:03805|Vega:Otthumg00000159812
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q21.3
Pascal P值 0.802
Sherlock P值 0.414
胎儿β -0.421
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
支持 细胞内贩运
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13284070 3 128483832 Rab7a 1.525E-4 0.475 0.032 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CHM DXS540 |FLJ38564 |GGTA |HSD-32 |MGC102710 |rep-1 |TCD 绒毛膜血症(Rab护送蛋白1) - HPRD,Biogrid 9563513|12576024
EIF1B GC20 真核翻译起始因子1b 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
Rab17 FLJ12538 Rab17,Ras Oncogene家族成员 两个杂交 Biogrid 10329441
rab22a MGC16770 Rab22a,Ras Oncogene家族成员 两个杂交 Biogrid 10329441
Rab4a HRES-1/RAB4 |rab4 Rab4a,Ras Oncogene家族成员 两个杂交 Biogrid 10329441
rab4b FLJ78649 |MGC52123 Rab4b,Ras Oncogene家族成员 两个杂交 Biogrid 10329441
Rab5a rab5 Rab5a,Ras Oncogene家族成员 两个杂交 Biogrid 10329441
Rab5b - Rab5b,Ras Oncogene家族成员 两个杂交 Biogrid 10329441
Rab6a Rab6 |rab6a'|Rab6b Rab6a,Ras Oncogene家族成员 两个杂交 Biogrid 10329441
Rabac1 pra1 |praf1 |yip3 RAB受体1(原始化) - HPRD 10329441
Rheb MGC111559 |Rheb2 富含大脑的Ras同源物 共定位 Biogrid 15809346
里尔 FLJ31193 |PP10141 Rab相互作用的溶酶体蛋白 - HPRD,Biogrid 11179213
RNF115 BCA2 |ZNF364 环手指蛋白115 - HPRD 12972561


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta Rab Pathway 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL12 2 Pathway 63 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid ajdiss 2Pathway 48 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR2途径 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MHC II类抗原表现 91 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 UP 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化 77 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化CCNE1 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射4的响应4 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng DNA损坏紫外线 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO或UV 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇7的时间反应7 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因