基因页:Rab7a
概括?
基因 | 7879 |
象征 | Rab7a |
同义词 | Pro2706 | Rab7 |
描述 | Rab7a,Ras Oncogene家族成员 |
参考 | MIM:602298|HGNC:HGNC:9788|Ensembl:ENSG0000000075785|HPRD:03805|Vega:Otthumg00000159812 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q21.3 |
Pascal P值 | 0.802 |
Sherlock P值 | 0.414 |
胎儿β | -0.421 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 元 |
支持 | 细胞内贩运 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13284070 | 3 | 128483832 | Rab7a | 1.525E-4 | 0.475 | 0.032 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RAB7A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CHM | DXS540 |FLJ38564 |GGTA |HSD-32 |MGC102710 |rep-1 |TCD | 绒毛膜血症(Rab护送蛋白1) | - | HPRD,Biogrid | 9563513|12576024 |
EIF1B | GC20 | 真核翻译起始因子1b | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
Rab17 | FLJ12538 | Rab17,Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
rab22a | MGC16770 | Rab22a,Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
Rab4a | HRES-1/RAB4 |rab4 | Rab4a,Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
rab4b | FLJ78649 |MGC52123 | Rab4b,Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
Rab5a | rab5 | Rab5a,Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
Rab5b | - | Rab5b,Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
Rab6a | Rab6 |rab6a'|Rab6b | Rab6a,Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
Rabac1 | pra1 |praf1 |yip3 | RAB受体1(原始化) | - | HPRD | 10329441 |
Rheb | MGC111559 |Rheb2 | 富含大脑的Ras同源物 | 共定位 | Biogrid | 15809346 |
里尔 | FLJ31193 |PP10141 | Rab相互作用的溶酶体蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 11179213 |
RNF115 | BCA2 |ZNF364 | 环手指蛋白115 | - | HPRD | 12972561 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta Rab Pathway | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL12 2 Pathway | 63 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid ajdiss 2Pathway | 48 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL8 CXCR2途径 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome MHC II类抗原表现 | 91 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 UP | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化CCNE1 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射4的响应4 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng DNA损坏紫外线 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO或UV | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由Kras Pten Up | 181 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇7的时间反应7 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |