概括
基因 788
象征 SLC25A20
同义词 cac | cact
描述 Solute Carrier家族25成员20
参考 MIM:613698|HGNC:HGNC:1421|Ensembl:ENSG00000178537|HPRD:01953|Vega:Otthumg00000133538
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.31
Pascal P值 0.03
Sherlock P值 0.599
胎儿β -0.485
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.51

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25624927 3 48936479 SLC25A20 1.265E-4 -0.54 0.03 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005488 捆绑 IEA -
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
GO:0015227 酰基肉碱转运蛋白活性 经验 9399886
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006810 运输 IEA -
去:0006853 肉碱班车 经验 11257506
去:0046320 调节脂肪酸氧化 经验 16054041
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005743 线粒体内膜 经验 9399886
去:0005743 线粒体内膜 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧DN 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lucas HNF4A靶向 58 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MF 47 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
苏肝 55 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Noushmehr GBM被甲基化沉默 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向 112 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 145 152 1A,M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 145 151 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-26 194 200 1a HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu